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Nat Biotechnol && J Comput Biol:开发出新算法对单细胞基因组进行测序

2012年8月13日 讯 /生物谷BIOON/ --美国加州大学圣地亚哥分校计算机科学家Pavel Pevzner领导的一个国际研究小组开发出一种新的算法来对有机体单个细胞的基因组进行更加快速地和更加准确地测序。这个新的算法被称作SPAdes,能够被用来对不能利用标准克隆技术进行处理的细菌进行测序,其中研究人员将这些细菌称作生命的暗物质,比如医院中发现的一些病原体,在深海或人胃肠道中存在的细菌。

2012-11-19

辉瑞与Nodality达成单细胞网络分析(SCNP)技术合作协议

2012年8月9日讯 /生物谷BIOON/ --美国生物技术公司Nodality本周四宣布与辉瑞(Pfizer)达成一项多年合作协议,关于利用Nodality专有的单细胞网络分析(SCNP,single cell network profiling)技术开发辉瑞下属的药物化合物。

2012-08-10

:科学家开发出单细胞水平实时检测癌细胞代谢仪器

2013年3月15日讯 /生物谷BIOON/--癌细胞降解葡萄糖产生代谢性乳酸的量明显比正常细胞高。采用诸如PET扫描的方法诊断乳酸含量能够提示机体是否存在癌细胞。智利科学家开发出一种能够在单细胞水平实时监测乳酸含量的仪器,有望能够更准确的诊断癌症。 目前还没有非侵入性的在单细胞水平实时监测乳酸水平的仪器,发表在近期PLOS ONE杂志上的文章在该方面取得了巨大进步。

2013-03-15

贺建奎:单细胞基因组学的兴起

上周在美国冷泉港(Cold Spring Harbor)参加了单细胞分析会议(single cell analysis), 这是一个非常令人激动的前沿学术会议,深深的体会到了单细胞基因组学的时代已经来临。 Cold Spring Harbor的会议是公认的高水准的会议,它有几个特点:首先,所做的报告都是最新的研究,组织方特别强调,希望介绍尚未发表的研究进展。

2013-03-20

Science:单细胞基因组测序

2012年12月22日讯 /生物谷BIOON/-- 基因组测序需要用PCR技术扩增出足够量的DNA片段。由于PCR扩增具有偏好型而且基因组具有大量的冗余,造成了基因组测序准确性不高。

2012-12-23

Mol.Cell:发现细胞调节mRNA前体丰度的分子机制

Poly(A)结合蛋白(PolyA tail binding proteins,PABPs)在mRNA的多聚腺苷化、维持mRNA稳定性和翻译调节过程中起重要作用。具有合适长度的Poly(A)是mRNA出核翻译的前提,Poly(A)解聚的mRNA会被迅速降解。

2012-11-18

Nature:用单细胞基因组探索多样性

宏基因组研究极大地提高了我们对于细菌以及古细菌多样性的理解。然而,环境宏基因组数据往往不容许个别物种的基因组组装,因此,大多数完整的基因组序列来自于培养的微生物。如今,两个新的大规模研究利用单细胞基因组,直接从未培养的环境样本中恢复了细菌和古细菌基因组。

2013-10-13

:单细胞的转录组成像

2013年10月8日讯 /生物谷BIOON/--苏黎世大学生物学家开发出一种能够可视化单个细胞内基因活性的方法。该方法非常高效,能够同时观测数千个人细胞内的每个细胞的所有基因表达情况。 该方法在基础医学领域和医学诊断学领域应用前景广阔。通过该方法,科学家发现单个细胞之间的基因活性,空间结构导致细胞间表达的分子差异非常巨大。 检测基因活性在医学诊断学特别是癌症诊断领域是一项常规的检查。

2013-10-08