Mol.Cell:发现细胞调节mRNA前体丰度的分子机制
Poly(A)结合蛋白(PolyA tail binding proteins,PABPs)在mRNA的多聚腺苷化、维持mRNA稳定性和翻译调节过程中起重要作用。具有合适长度的Poly(A)是mRNA出核翻译的前提,Poly(A)解聚的mRNA会被迅速降解。
Nature:用单细胞基因组探索多样性
宏基因组研究极大地提高了我们对于细菌以及古细菌多样性的理解。然而,环境宏基因组数据往往不容许个别物种的基因组组装,因此,大多数完整的基因组序列来自于培养的微生物。如今,两个新的大规模研究利用单细胞基因组,直接从未培养的环境样本中恢复了细菌和古细菌基因组。
Science:单细胞测序显示:同一个人的不同神经元DNA序列不一样
2013年11月3日 讯 /生物谷BIOON/ --之前大家一直认为一个人体内的每个细胞都有相同的遗传信息,基因组的特殊表达模式使得不同细胞的功能各异。然而最近发表在Science杂志上的文章推翻了该观点。 确定一个人的不同神经元的基因组只能采用单细胞基因组测序的方法。索尔克研究所的科学家采用单细胞基因组测序的方法发现同一个人中不同的神经元基因组存在多样性。
Cell:发现细胞中mRNA自我摧毁机制
美国叶史瓦大学艾伯特-爱因斯坦医学院研究人员发现细胞利用第一个已知的机制控制mRNA的存活。这些关于mRNA的发现可能对逆转癌症不受调控的细胞分裂提供启示。2011年12月22日,该研究发表在《细胞》期刊上。 该研究通信作者Robert Singer博士说,“我们研究的mRNA分子命运类似希腊悲剧。它们的命运在诞生那一刻就被决定了。
Nature:单细胞DNA测序揭示微生物“暗物质”
据《自然》杂志网站北京时间7月15日报道,天文学家们认为,宇宙总物质量的23%由弥漫于其间且肉眼看不见的“暗物质”组成;现在,美国科学家进行了微生物“暗物质”研究,他们用单细胞DNA测序技术对多种微生物的基因组进行测序后发现,微生物远比我们所知道的要丰富多样,研究同时揭示了不同物种间令人惊奇的关联。
J Cell Sci:利用单细胞生物研究AD相关蛋白的功能
Nature:DNA测序有助于鉴定免疫系统攻击的癌症细胞
根据圣路易斯华盛顿大学医学院的科学家,肿瘤细胞的DNA序列可用于指导免疫系统攻击癌症。 此面小鼠上的研究发表在2月8日的Nature上。 免疫系统依赖于一个复杂的警报网络系统,这个系统针对并安全地制动决定何时攻击并攻击什么。新研究结果指出,科学家可能现在能将DNA测序数据与他们的触发器与靶标认识相结合,这种认识使免疫警钟更精确地发展癌症疫苗与癌症其他免疫治疗法。
:新基因组测序方法能够在单细胞水平上分析基因表达谱
生物学家和遗传学家长期以来想要在单个细胞水平上分析基因表达谱,但是技术限制一直使得它不能成为现实。 根据2012年7月22日在线发表在Nature Biotechnology期刊上的一项研究,研究人员第一次证实一种新的被称作Smart-Seq的基因组测序方法能够帮助科学家们对临床上重要性的单个细胞进行深入分析。Smart-Seq可能有着很多方面的应用,包括帮助科学家们更好地理解肿瘤产生的复杂性。
Nat Biotechnol && J Comput Biol:开发出新算法对单细胞基因组进行测序
2012年8月13日 讯 /生物谷BIOON/ --美国加州大学圣地亚哥分校计算机科学家Pavel Pevzner领导的一个国际研究小组开发出一种新的算法来对有机体单个细胞的基因组进行更加快速地和更加准确地测序。这个新的算法被称作SPAdes,能够被用来对不能利用标准克隆技术进行处理的细菌进行测序,其中研究人员将这些细菌称作生命的暗物质,比如医院中发现的一些病原体,在深海或人胃肠道中存在的细菌。