揭示利用新开发的ExSeq测序技术高分辨率确定RNA在细胞中的位置
2021年1月29日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国麻省理工学院和哈佛医学院的研究人员利用一种新的组织扩张技术，设计了一种方法，对组织样本中的信使RNA（mRNA）分子进行标记，然后对mRNA进行测序。相关研究结果发表在2021年1月29日的Science期刊上，论文标题为“Expansion sequencing: Spatially
从单细胞转录组中解析出人类肿瘤中的拷贝数和克隆亚结构
美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心Nicholas E. Navin团队开发出新方法，可从单细胞转录组中解析出人类肿瘤中的拷贝数和克隆亚结构。该研究于近日在线发表于国际一流学术期刊《自然—生物技术》。研究人员表示，单细胞转录组学分析被广泛用于研究人类肿瘤。然而，将肿瘤微环境中的正常细胞类型与恶性细胞区分开并解析肿瘤内的克隆亚结构仍然具
Nat Med：单细胞测序揭示胃癌患者差异化结局的原因
德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员对来自腹膜癌（一种特定形式的转移性胃癌）患者的45,000多个细胞进行了分析，确定了广泛的细胞异质性，并确定了与患者生存相关的两种不同亚型。
基于CRISPR/Cas9的单细胞谱系追踪，揭示癌症异种移植物转移的速率、途径和驱动因子
2021年1月25日讯/生物谷BIOON/---当癌症局限于身体的一个部位时，医生通常可以通过手术或其他疗法进行治疗。然而，大部分与癌症有关的死亡，是由于它的转移倾向，发送自己的种子，可能在全身生根。转移的确切时刻转瞬即逝，迷失在肿瘤中发生的数百万次分裂中。美国怀特黑德研究所成员Jonathan Weissman说，“这些事件通常是不可能实时监测的。”如今，
研究构建一个单细胞取样及小RNA检测的集成式单细胞电化学检测器件
细胞是生命结构和功能的基本单位，基于细胞的研究是生命研究的基础。为了揭示生命活动的规律，人们在不断的探索细胞的生长与分化、代谢与繁殖、运动与通讯、衰老与凋亡、遗传与进化等生命过程中的化学本质和规律。但是，由于细胞自身特性和研究手段的限制，当下生命科学研究通常以大量细胞为研究样本，然而基于大量细胞的实验结果难以反映单细胞水平上的生命活动
中山眼科中心肖传乐和刘奕志团队开发Nanopore测序数据新校正组装算法，并组装视网膜母细胞瘤的高完整度基因组
三代测序技术（PacBio和Oxford Nanopore）可解决基因组重复区域的组装难题，提高基因组完整性，已成为发育、再生、肿瘤和其它疾病过程中细胞基因组组装的主流技术。其中，纳米孔（Nanopore）测序技术的迅速发展更使得测序成本显着降低，并且由于其可实现超长读长（高达1Mbp），在复杂基因组组装中具有天然优势。然
步辐射单细胞红外显微成像研究获进展
单细胞技术因有望揭示“细胞功能异质性机制”这一生命科学的本质问题，从而解析各种慢性疾病（如癌症、糖尿病和神经退行性疾病）和衰老的分子基础，是当前生物医学的研究热点和重点方向。单细胞技术在测序方面取得了进展；由于该技术具有无须标记、非侵入性、可同时展示胞内代谢物（组）特征等优点，逐渐得到学界关注。近期，中国科学院上海高等研究院研究员吕军鸿课题组先后
细胞应激颗粒中的mRNA确实可以表达蛋白
2020年12月16日讯/生物谷BIOON/---就像人一样，细胞也会遭受应激。突然的氧气下降、过热或毒素都会引发一连串的分子变化，导致细胞停止生长，产生应激保护因子，并形成应激颗粒（stress granule）---蛋白和RNA分子挤在一起形成的无膜细胞器。虽然应激颗粒的功能在很大程度上仍然是未知的，但人们认为它们只含有不被翻译成蛋白的RNA。如今，一项
Cell：对埃博拉病毒进行单细胞研究，揭示了这种病毒的致命策略
2020年11月15日讯/生物谷BIOON/---埃博拉病毒是世界上最致命的病原体之一。如今，在一项新的研究中，来自美国国家卫生研究院（NIH）、布罗德研究所、麻省理工学院和斯坦福大学等研究机构的研究人员报告了埃博拉病毒在感染过程中如何改变宿主免疫反应以有利于自己的新细节。他们鉴定出这种病毒抑制的抗病毒防御基因，以及这种病毒激活的其他基因，以便潜在地促进它在
研究开发出基于深度学习的单细胞转录组分析模型
单细胞转录组作为单个细胞的特征，可更加精确地定义细胞的类型。常规的基于单细胞转录组的分类方法首先是进行无监督的聚类，然后根据每个集群（Cluster）特异表达的细胞标记基因来对集群进行标注。虽然基于无监督的分类方法更容易发现新细胞类型，但是人工标注的过程费时费力。目前已有的基于监督学习的自动分类方法，大部分无法兼顾到方法的可解释性以及