单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。
2024-02-21
Nature子刊:浙江大学孙会增/王永成团队开发微生物组单细胞转录组学技术,揭示奶牛瘤胃微生物活性功能类群
该研究利用MscT技术,通过基于BGMGM的泛基因组功能基因比对策略,揭示了瘤胃微生物生态系统原位活性代谢功能类群。
2024-06-16
李程/孙育杰/黄粤团队揭示异倍体对染色质空间结构和转录组的影响
本研究结合Hi-C、RNA-seq、染色体成像和新生RNA成像技术,探究了异倍体ESC相比正常二倍体ESC在染色质三维结构和基因转录层面的变化。
2024-04-12
Cell:清华大学李寅青/李丕龙团队揭示基因表达的“保温杯”——具有相分离能力双效应转录因子
这项研究揭示了一类具有相分离能力的dual-action TFs,它们通过选择性地招募转录核心组件,实现其独特的双效转录调节功能。
2024-04-21
Nat Cell Biol:科学家识别出肠道菌群和兴奋性大脑信号之间的特殊分子关联
来自马萨诸塞大学医学院等机构的科学家们通过研究揭示了秀丽隐杆线虫机体肠道中产生维生素B12的特定细菌与乙酰胆碱(acetylcholine)产生之间的重要分子关联。
2024-01-17
Pharmaceuticals:常见的HIV逆转录酶抑制剂药物可能有助降低HIV感染者的阿尔茨海默病发病率
本研究了随着年龄增长而服用逆转录酶抑制剂和其他抗逆转录病毒联合疗法的 HIV 阳性患者,并提出了一个问题:他们中有多少人患上AD?
2024-04-26
Cell:DNA引导的转录因子协同作用塑造了面部和肢体间充质
近段时间,来自斯坦福大学化学与系统生物学系的Seungsoo Kim教授及其团队通过比较人类和黑猩猩面部颅神经嵴细胞的增强子图谱,发现了其增减与增强子活性变化相关的图案,研究TF 协同结合的功能影响。
2024-01-29
Cancer Discov | 北京大学汤富酬/周鑫揭示了结直肠癌分子亚型的表观遗传基础和特征转录因子
该研究系统地揭示了著名的iCMS和CIMP分类的CRCs的表观遗传学基础。
2024-03-12