研究揭示H3K27me3识别与转录抑制调控的新机制
近期,中国科学院分子植物科学卓越创新中心、上海植物逆境生物学研究中心研究员段成国课题组和研究员朱健康课题组合作,在Nature Communications上,发表了题为Coupling of H3K27me3 recognition with transcriptional repression through the BAH-PHD-CPL2
Science | 颠覆教科书的发现:冷冻电镜揭示转录背后的故事
在转录阶段,RNA需要在正确的位置终止,究竟是谁在负责这一过程?五十年前,科学家们推测到一个可能的模型:一种六聚体环状的RecA家族RNA转位酶ρ(Rho),能够先与RNA结合,参与ATP驱动的RNA聚合酶向RNA的转位,当RNA聚合酶停止时,ρ便帮助特定的RNA片段从DNA上离开【1】。这也是教科书里面给我们的解释。但是,一些研究者意识到这种说
新研究破解调节造血干细胞体内和体外产生的糖密码
2020年12月7日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国耶鲁大学的研究人员在将上皮细胞转变为造血干/祖细胞(hematopoietic stem and progenitor cell, HSPC)的过程中发现了一个关键的生物环节。相关研究结果发表在2020年12月4日的Science期刊上,论文标题为“The N-glycome regu
Nat Biotechnol:对人多能性干细胞进行定制化转录因子编程,产生数百种分化细胞
2020年12月5日讯/生物谷BIOON/---诱导性多能干细胞(iPS)有潜力转化为多种细胞类型和组织,用于药物测试和细胞替代疗法。然而,这种转化的“配方”往往很复杂,难以实现。在一项新的研究中,来自德国德累斯顿工业大学再生治疗中心、波恩大学和美国哈佛大学的研究人员发现了一种利用转录因子系统性地从ips细胞中快速和轻松地提取神经元、结缔组织细胞和血管细胞等
揭示Rho让RNA聚合酶失活终止转录新机制
2020年11月29日讯/生物谷BIOON/---基因表达分为转录阶段和翻译阶段。科学家们之前一直并不知道在细胞中,DNA转录一旦开始,是如何被正确关闭的。在转录过程中,一种称为RNA聚合酶的酶将自身包裹在DNA的双螺旋周围,使用一条DNA链与核苷酸匹配以形成遗传物质的副本---一条新合成的RNA链,该RNA链的合成在转录完成后会释放出来。所产生的RNA可以
体外多酶体系催化合成氨基葡萄糖研究获进展
氨基葡萄糖(glucosamine,氨糖)是一种重要的功能性单糖,在食品等行业具有广泛用途。随着人口老龄化的加剧、运动人群的增加以及氨糖更广泛的应用开发,氨糖的需求量持续上升。传统生产氨糖的方法中,甲壳素水解法环境污染严重,易导致过敏反应;发酵法由于氨糖抑制菌株生长导致发酵产物为乙酰氨糖,需进一步酸解或酶解获得氨糖。因此,亟须开发绿色、高效、一步法氨糖生产新
利用纳米孔测序研究人体组织样本等位基因效应对转录组结构的影响
不同的组织和个体之间的基因表达和调控的差异很大,大部分的常见复杂性状相关的基因组通过假定表达和剪接机制来发挥作用,如10%的致病突变都具有已知的剪接效应,RNA测序则能够很好的分析等位基因特异性并解读遗传变异。迄今为止的大多数RNA测序研究都使用短读长RNA测序技术;由于短读长容易出现多重定位的情况,因此很难确定异构体的来源,同时会给定量带来干扰
Cell:我国科学家揭示新冠病毒复制转录复合体的低温电镜结构
2020年11月17日讯/生物谷BIOON/---SARS-CoV-2 mRNA的转录需要由复制转录复合体(replication and transcription complex, RTC)促进的一系列反应。在一项新的研究中,来自中国清华大学、上海科技大学和武汉大学的研究人员展示了SARS-CoV-2 RTC向cap结构合成过渡时的结构快照。他们解析出由
研究开发出基于深度学习的单细胞转录组分析模型
单细胞转录组作为单个细胞的特征,可更加精确地定义细胞的类型。常规的基于单细胞转录组的分类方法首先是进行无监督的聚类,然后根据每个集群(Cluster)特异表达的细胞标记基因来对集群进行标注。虽然基于无监督的分类方法更容易发现新细胞类型,但是人工标注的过程费时费力。目前已有的基于监督学习的自动分类方法,大部分无法兼顾到方法的可解释性以及
Science:从头设计的蛋白诱饵在体外阻断新冠病毒感染,在体内保护仓鼠免受感染
2020年11月11日讯/生物谷BIOON/---Neoleukin医疗公司(Neoleukin Therapeutics, Inc.,下称Neoleukin公司)是一家利用复杂的计算方法从头设计蛋白药物的生物制药公司。如今,在一项新的研究中,Neoleukin公司描述了旨在治疗或预防SARS-CoV-2感染的新分子。相关研究结果于2020年11月5日在线发表