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AI蛋白设计再登Nature:Diffusion模型助力更强的蛋白质从头设计

该研究开发了蛋白质从头设计的深度学习算法——Family-wide Hallucination,并通过实验室测试证实,这些自然界中不存在的人造酶可以非常有效地催化荧光素底物发光。这是科学界首次基于深度

2023-07-14

单结构域蛋白质索烃的设计和合成方面取得重要进展

以对蛋白质进行环化、索烃化、打结等拓扑改造为代表的蛋白质拓扑工程是一种重要的调控蛋白质性质的手段。近年来,基于可基因编码的蛋白质缠结基元和反应基元的“组装-反应协同”理念,发展

2023-07-26

Advanced Science:赵英明/黄河等揭示全新蛋白质修饰类型

细胞代谢为生命过程提供能量,同时,代谢物可共价修饰蛋白质来发挥信号传导功能。虽然许多代谢物在代谢通路中的作用广为人知,但它们介导细胞信号调控的功能有待探索。

2023-07-10

EMBO Reports封面论文:王磊/刘光慧合作揭示蛋白质氧化折叠在干细胞衰老中的作用

研究团队发现,作为参与蛋白质氧化折叠的关键分子蛋白质二硫键异构酶PDI,在多种人体细胞衰老模型和老年小鼠组织中均表达上调,敲除PDI能够降低蛋白质氧化折叠速率,延缓干细胞的衰老。

2023-08-07

科研人员开发基因编码的光控蛋白质标记新技术

邹鹏课题组利用RinID技术系统研究了多个亚细胞区域的蛋白质组,包括线粒体、内质网、细胞核等,均获得了出色的空间特异性(>90%),高于目前常用的APEX2、TurboID等技术。

2023-07-11

哈佛教授捐赠2.1亿美元用于蛋白质创新研究,计划加速蛋白质和抗体发现

官方新闻稿中指出,这笔捐赠将进一步支持蛋白质创新研究所的发展,以利用新的蛋白质工具和专业知识转变生物医学研究。

2023-06-05

MIT团队提出蛋白生成新模型,无需预训练,可从头生成新蛋白质,主链长度可达500个氨基酸序列

近日,麻省理工学院的研究人员开发出了一种扩散模型 FrameDiff,这是一种生成式深度学习工具,能够生成自然界中不存在的新型蛋白质结构。在研究中,研究团队将 FrameDiff 应用于蛋白质主链生成

2023-07-24

Cell:利用TransitID动态绘制活细胞内和活细胞间的蛋白质组转运

我们DNA中的遗传计划通过蛋白实现了功能,而蛋白是我们身体结构和活动的基础。然而,蛋白质组---细胞或特定区域内的所有蛋白---仍然是相对神秘的,因为蛋白景观是非常复杂的。例如,人类制造了数以万计的不

2023-07-09

Cell:开发新型邻近蛋白质组学技术,第一作者秦为已回国加盟清华大学

大城市内的地铁线路错综复杂,每天不同的人会从一个站点通勤到另一个站点,承担着自己的社会责任。细胞内的蛋白质在时间和空间等维度上也是高度动态的,很多蛋白会在不同的细胞器之间甚至是不同的细胞之间进行转运和

2023-07-03

麻省理工团队开发类ChatGPT模型,基于蛋白质大语言模型,加速AI药物发现

开展一个药物筛选项目就像举办一场大型酒会,并旁听和记录整个过程。在酒会上的绝大多数交流只是闲聊,有意义的谈话只占极少数。药物筛选同样如此,微弱的药物靶标相互作用远超高亲和力的结合。

2023-06-16