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合成生物学元件与数据库发布

该团队设计并构建了合成生物学元件和数据库RDBSB,在线提供了系统审编的定性和定量催化信息,如元件的活性、底物、催化反应最佳pH值和温度以及底盘特异性等关键参数。

2024-10-18

Science:新研究揭示DNA重复元件阻断造血干细胞吞噬机制

这些研究结果支持这样一种模式,即内源性TLR3配体导致b2m的表达,从而阻断巨噬细胞诱导的吞噬,并通过用巨噬细胞监测干细胞质量来确定造血干细胞的克隆性。

2024-09-20

谷氨酸棒杆菌全基因组规模筛选新型功能元件方面获进展

本研究作为生物铸造厂的应用场景之一,提供了新型功能元件筛选的系统策略。

2024-11-22

Mol Cell:涂镇波等揭示转座元件衍生基因在肿瘤中的关键作用机制

本研究阐明了POGK通过其KRAB结构域与转录抑制因子TRIM28结合,形成转录抑制复合物,从而抑制小核糖体亚基RPS16和RPS29的基因转录。

2024-11-25

刘毓文/倪建泉团队开发基于人工智能的DNA顺式调控元件设计新方法

DREAM兼具超高的元件活性性能预测能力以及良好的生物学可解释性,因此DREAM可以将学习到的增强子的调控语法用于后续的元件设计任务之中。

2024-11-27

Cell:揭开人类肠道中数量最多遗传元件——隐秘质粒pBI143

研究团队通过霰弹枪宏基因组学和全新质粒预测算法对来自人类肠道的68000多个质粒进行了表征,并在不同地理、不同种族的人群中发现了一种最普遍存在的隐性质粒——pBI143。

2024-03-31

缺氧环境下细胞外囊泡中环状RNA转运之谜!Adv Sci (Weinh):FUS蛋白在缺氧神经元中显著上调,促进circRNAs在sEVs中的选择性装载

该研究阐述了FUS如何选择性地促进circRNAs在缺氧神经元中的sEV装载,揭示了sEV介导的circRNA转运机制,并深化了我们对于细胞响应缺氧的理解。

2024-08-14

Nature: 新开发的TATSI技术利用转座元件将定制DNA整合到植物基因组的特定位点

TATSI 技术利用了植物转座元件 20 多亿年进化的优势,这些转座元件就像经过磨练的分子机器,自然而然地将 DNA 导入宿主基因组中。

2024-07-14

Redox Biol:牦牛活性肽通过抑制VEGF/MAPK/炎症信号传导抑制缺氧诱导的肺损伤

从牦牛奶渣中提取的肽Leu-Val-Tyr- Pro-Phe-Pro-Gly-Pro-Ile-Pro-Asn (LV)可能对持续缺氧引起的急性肺损伤具有潜在的保护作用。

2024-07-30

缺氧环境下的免疫战士」Sci Adv:肿瘤中较低的氧气水平或能增强机体抵御癌症的能力

本文研究结果挑战了关于缺氧对巨噬细胞影响效应的范式,并强调了一种可操控的靶向细胞来调节机体的抗癌免疫反应。

2024-10-08