Cell:利用Perturb-seq技术大规模探究与关键发育基因相关的脑细胞类型
研究人员发明了一种名为体内Perturb-seq的新技术。这种方法利用CRISPR-Cas9技术和单细胞转录组分析,一次一个细胞地测量对细胞的影响。
Cell:新研究指出人类scRNA-seq 数据集存在隐私泄露风险,应加强保护
利用不同实验室生成的数据,甚至用不同方法处理的数据,然后用它来将完全不同的匿名数据集中的个体关联起来,这种能力相当惊人,而且凸显了单细胞数据的真正隐私问题。
Nat Cell Biol丨蓝勋和孟安明合作开发高通量、低成本SPATAC-seq技术并绘制斑马鱼早期胚胎发育染色质可及性图谱
SPATAC-seq是一种基于单细胞组合索引(Single-cell combinatorial indexing)原理设计开发的单细胞染色质可及性技术。
Nature:利用新开发的Slide-tags技术在单细胞分辨率上构建组织内细胞遗传活动的空间模式图谱
当科学家们想要在分子水平上研究心脏或大脑等器官内的单个细胞时,他们通常会将组织打碎来分析细胞。这提供了有关基因活性的丰富细节,但无法保留细胞在组织中的位置信息。
Nature子刊:何川团队开发RNA结合蛋白靶点检测新方法——ARTR-seq
在这项研究中,何川团队为了克服现有方法的局限性,提出了一种基于逆转录酶(RT)的RBP结合位点测序方法——ARTR-seq,通过原位逆转录酶捕获RBP-RNA相互作用。
Nature:利用FIND-seq成功分离和分析在多发性硬化症中发挥关键作用的星形胶质细胞亚群
在一项新的研究中,研究人员通过结合核酸细胞仪、微流控技术和液滴分选,开发出FIND-se,可根据数字液滴PCR检测的mRNA生物标志物的表达来分离和分析感兴趣的罕见细胞。
重磅 | 人人可及,时空组学技术Stereo-seq再次升级
未来,时空组学将朝着智慧实验室、多样本多组学、便捷与开放的平台方向,打造全方位的时空生态系统,降低科学发现的门槛,赋能更多领域的科学研究。
Science:我国科学家利用单细胞Stereo-seq揭示损伤诱导的室管膜胶质细胞亚群参与蝾螈大脑再生
大脑再生需要以时间和区域特定的方式协调复杂的反应。确定参与这一过程的细胞类型和分子将促进我们对大脑再生的理解,并为再生医学研究提供潜在的靶标。
开发Live-seq技术,可以对细胞进行测序而不杀死它
在一项新的研究中,来自瑞士洛桑联邦理工学院的Bart Deplancke教授及其研究团队和苏黎世联邦理工学院的Julia Vorholt教授及其研究团队解决了scRNA-seq的一个问题:需要裂解
Genome Biol:开发出NT-seq方法,可同时检测细胞中的三种不同类型的DNA甲基化
细胞控制它们的基因活性的一种方式是在DNA上添加小的化学修饰,以决定哪些基因开启或关闭。