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Nat Methods:开发出基于CRISPR/Cas9和单细胞RNA测序的CROP-seq方法

在一项新的研究中,来自奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Christoph Bock及其团队开发出一种新方法:将CRISPR集中筛选和按序筛选(arrayedscreen)的优势结合在一起。通过将CRISPR基因组编辑与单细胞RNA测序整合在一起,他们在单个实验中研究上千个细胞,从而能够平行地确定多种基因的调控影响。

2017-01-23

Science:开发出TT-Seq技术绘制人类瞬时转录组图谱

在一项新的研究中,研究人员开发出一种TT-Seq方法可以用于发现活跃的可控制基因活性的调节性DNA序列。

2016-06-04

解读单细胞RNA-seq技术

多年来,跟踪一个单细胞的转录组,超出了我们的能力。但是现在,时代已经变了,新的单细胞RNA-seq方法,可以分析大量的细胞及它们的命运。我们都参加过大型生日派对:在拥挤的房间里,与许多人聊天、吃饭和庆祝。但

2015-03-26

Nature Methods发布重磅结果:新测序技术——Ribose-seq

核糖核苷酸是RNA的基本单位,它们会在DNA复制和修复过程中嵌入基因组DNA,进而影响基因组的稳定性。然而,迄今为止人们还无法鉴定和定位这些插入DNA的核糖核苷酸。

2015-03-26

DNA Repair:浙大黄俊等解析DNA修复机制

近期来自浙江大学生命科学研究院、韩国成均馆大学、香港大学和美国M.D.安德森癌症中心的研究人员联合发表了题为“RAD18-BRCTx interaction is required for efficient repair of UV-induced DNA damage”的研究论文,揭示了RAD18蛋白通过与BRCTx互作参与DNA损伤的复制后修复的作用机制。

2012-11-19

DNA Repair:裂殖酵母采用多种末端连接法修复DNA损伤

11月16日,DNA Repair在线发表了北京生命科学研究所研究员杜立林实验室的最新研究成果,首次报道了一个在裂殖酵母中检测染色体上进行的末端连接修复的方法,并利用此方法分析了机理不同的三类末端连接修复方式。 非同源末端连接(NHEJ)是哺乳动物中修复DNA双链断裂的主要方式。参与NHEJ的修复蛋白如Ku,ligase IV,XLF,和X家族DNA聚合酶在裂殖酵母中都是保守的。

2012-11-18

系统比较RNA-Seq基因谱

BioRxiv最新收录的文章通过对不同RNA-Seq研究工具的比较来分析哪些工具更胜任转录组研究工作。

2014-05-27