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Nature Genetics:赵方庆团队开发高通量三维空间转录组新技术

MAGIC-seq提出了“拼接芯片”的概念,即通过调整网格间距和多轮编码的方式将多个捕获网格拼接在一起,突破了传统微流控方法的通道限制,实现了高分辨率与大视野的兼顾。

2024-09-13

Cell Rep:刘行/姚雪彪/王志凯合作揭示细胞更新转录调控新机制

该研究发现了书签标识因子FOXA1在细胞有丝分裂期过程中DNA结合模式转变的磷酸化调控机制,以及FOXA1转录凝聚体的形成与功能发挥的分子基础。

2024-09-22

Cell Metab:吕德官等揭示胶质母细胞瘤中调控表观转录的关键代谢途径

该发现揭示了MDH2是维持GSCs代谢和表观转录组网络的关键环节,为开发更为有效的靶向治疗方案铺平了道路。

2024-11-06

Mol Cell:HOXDeRNA 通过与基因组广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子

HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域,从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制,最终激活多个癌症驱动基因,驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。

2024-11-07

Nat Cell Biol:赵方庆团队开发基于编程控制的转录组实时测序新技术

该研究首次提出了转录组智能测序的概念,依托人工智能纳米孔自适应测序算法,能够实时判断测序分子来源,并可编程选择目标测序分子进行全长测序。

2024-11-03

研究提出可预防寨卡病毒感染的单剂接种环状RNA疫苗策略

该研究利用环状RNA编码来改良寨卡病毒抗原,并探讨了单剂接种即可预防寨卡病毒感染且无登革病毒感染增强风险的疫苗新策略。

2024-11-11

Nat Commun:通过整合细胞形态学和空间转录组学深度剖析肿瘤生态系统

METI是一种机器学习方法,它通过整合空间基因表达数据和病理学组织学特征,系统性地分析肿瘤生态系统。

2024-09-04

科研人员开发基于深度学习模型的空间转录组精细分辨率细胞注释算法

STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具,在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。

2024-11-10

Mol Cell:揭示RNA在调节癌细胞中基因表达上所扮演的关键角色

本文研究结果为阐明RNA和TOP1在调节RNAPII依赖性转录所固有的DNA拓扑异构压力中的协调作用提供了新的见解。

2024-09-04

Cell:新研究发现一种调节细胞衰老的非编码RNA分子——SNORA13

在这项新的研究中,研究人员利用一种名为 CRISPR 干扰的基因活性调节技术,在携带致癌突变的人体细胞中单独使数千种非编码 RNA 失活。

2024-07-26