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Cell:康奈尔大学郭春君团队成功开发针对非模式肠道细菌的基因编辑工具

多组学的研究表明很多肠道微生物的基因与宿主生理功能密切相关,但是由于这些基因大多源于非模式的肠道细菌,例如厚壁菌门梭菌纲,因此揭示这些基因影响宿主的机制目前是一项挑战。与我们所熟知的具有成熟基因编辑方法的模式肠道细菌 (例如大肠杆菌和多形拟杆菌) 不同,这些非模式肠道细菌大多未进行基因组测序,向其中引入含有基因编辑模块的外源DNA的方法以及采用何种合适的基因

2022-01-22

打开肠道微生物组“窗口”:科研人员开发出流程化、更高效的基因编辑工具

  基因,就像是指挥官手里拿着的建筑总图纸,调控着生物体的一切生命活动。这份施工的图纸决定了整个建筑的所有呈现形式。那怎么才能对“图纸”——基因进行编辑呢?CRISPR/Cas编辑系统被认为是最佳的一种工具。中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所、深圳合成生物学创新研究院戴磊课题组在ACS Synthetic Biology上发表最

2022-01-11

Nucleic Acids Res:新型神经网络可更准确地评估CRISPR/Cas系统的DNA编辑效果

在一项新的研究中,来自俄罗斯科学院、斯科尔科沃科学技术研究所和美国国家生物技术信息中心的研究人员提出一种新的神经网络架构,可用于评估为基因编辑实验选择向导RNA(gRNA)的效果。他们的方法将促进用流行的CRISPR/Cas技术进行更有效的DNA修饰,因此将有助于开发新的策略来构建转基因生物,并找到治疗严重遗传性疾病的方法。

2021-12-31

Cell Rep:科学家开发出前所未有的工具来可视化分析研究DNA的修复过程

在机器学习应用于高通量显微镜等技术的帮助下,研究人员就能设法详细观察这种DNA修复机器,并能识别出一种新的修复蛋白,相关研究结果以题为“Assessing kinetics and recruitment of DNA repair factors using high content screens”的形式发表在国际杂志Cell Reports上,或有望未来帮助科学家们开发新型癌症疗法。

2021-12-31

Cell:新工具Repair-seq可用于改进CRISPR基因编辑

在第一项新的研究中,美国普林斯顿大学研究员Britt Adamson、麻省理工学院生物系教授Jonathan Weissman、之前在Editas Medicine公司工作的Cecilia Cotta-Ramusino及其同事们详细介绍了一种名为Repair-seq的新方法,它详细地揭示了基因组编辑工具如何发挥作用。

2021-10-31

新型DNA编辑工具Retron Editing的开发及优化研究取得进展

中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心、神经科学国家重点实验室、上海脑科学与类脑研究中心研究员杨辉研究组在Protein & Cell上发表了题为Precise Genome Editing without Exogenous Donor DNA via Retron Editing System in Human Cells 的研究论文,该研究优化

2021-09-07

最新研究发现NgAgo具有DNA编辑能力

 原核 Argonautes (pAgos) 已被提议作为更灵活的基因编辑工具,因为与流行的 CRISPR/Cas 系统不同,它们不需要与其功能目标相邻的序列基序。来自嗜盐古菌 Natronobacterium gregoryi的一种有前途的 pAgo (NgAgo)  候选物一直是关于其在真核系统中潜力的争论的主题。普渡大学Kevin

2021-09-07

CRISPR大牛张锋教授发现一类极具应用潜力的新型基因编辑系统---转座子编码的RNA引导的DNA内切酶

研究人员发现了一类新的可编程的DNA修改系统,称为OMEGA,它们可能天然地参与了在整个细菌基因组中重排小片段 DNA的工作。

2021-09-12

Cell:揭示DNA修复蛋白RAD51可让CRISPR基因编辑更高效

2021年7月6日讯/生物谷BIOON/---基因编辑是有目的地改变基因的DNA序列,是研究突变如何导致疾病,以及为治疗目的改变一个人的DNA的有力工具。在一项新的研究中,美国麻省理工学院大脑与认知科学教授Guoping Feng及其团队开发出一种可用于这两种目的的新型基因编辑方法。相关研究结果近期发表在Cell期刊上,论文标题为“Efficient emb

2021-07-06

Nature Methods:开发胞嘧啶碱基编辑器脱靶效应检测的新工具

北大-清华生命科学联合中心、北京大学生命科学学院伊成器教授课题组在Nature Methods杂志发表了题为“Detect-seq reveals out-of-protospacer editing and target-strand editing by cytosine base editors”的封面文章。研究人员在本研究工作的主要贡献如下:建立了一

2021-06-20