检测DNA甲基化维持效率的方法研究取得进展
中国科学院生物物理研究所研究员朱冰课题组在Nature Protocols上,在线发表了以Simultaneously measuring the methylation of parent and daughter strands of replicated DNA at the single-molecule level by Hammer-seq为题的
研究揭示成瘾行为形成的DNA去甲基化调控机制
成瘾性药物强化操作行为反应是药物滥用与成瘾的主要特征之一。在这种操作式条件反射的获得过程中,环境/线索与药物奖赏效应之间建立起的牢固联系,是长期戒断后环境/线索诱发复吸的重要原因。以往研究发现,海马CA1区发生DNA甲基化是成瘾记忆转化为长期记忆的关键,且可能是成瘾记忆有别于正常奖赏记忆的病理学基础之一(Zhang et al., 2
研究人员发表“组蛋白甲基化修饰在表观遗传调控和温度响应中的作用”综述文章
表观遗传调控是一种在进化上保守的调控机制,在真核生物中对于维持基因组稳定性、调控生长发育及对逆境的响应中具有重要作用。组蛋白甲基化修饰是一种重要的表观遗传调控机制,由组蛋白甲基转移酶和组蛋白去甲基化酶动态调控,这一表观遗传标记在植物生长发育和环境响应过程中具有广泛而动态的调控作用。环境温度对植物的生长发育具有重要影响,作为
科学家利用纳米孔测序同时获取染色质可及性和甲基化信息
近年来随着DNA测序技术的蓬勃发展,蛋白质结合位点的高通量鉴定、染色质可及性及甲基化状态分析等检测技术不断涌现,其中很多技术(如DNase-seq和ATAC-seq等)依赖于开放性染色质对转座酶等的敏感性。在这些新技术中,全基因组核小体定位及DNA甲基化组测序技术(NOMe-seq)能够利用外源性M. CviPI GpC甲基转移酶标记基因组可及性
纳米孔全长cDNA测序和直接DNA甲基化分析解决大麻基因组拷贝数的争论
大麻(Cannabis sativa)通常分为大麻(Marijuana)和工业大麻(Hemp),通常依据植物产生THC(四氢大麻酚)的含量来区分:大麻的THC含量通常较高(> 10%),工业大麻通常较低(<0.3%),但他们都可以产生高水平的CBD(大麻二酚),工业大麻可用作纤维和燃料且市场增长很快。2015年,索尔克生物研究所(Sa
研究阐述血液中细胞特异性的DNA甲基化改变
近期,中国科学院上海营养与健康研究所(中国科学院-马克斯·普朗克科学促进学会计算生物学伙伴研究所)研究员Andrew Teschendorff课题组与研究员汪思佳课题组合作,在Nature Communications上,在线发表题为A cell-type deconvolution meta-analysis of whole blood EW
纳米孔测序准确鉴定混合谱系(MLL)白血病复杂易位,识别差异性甲基化规律
急性白血病是一种骨髓癌症,特征是骨髓中由超过20%的白血病母细胞,治疗目标是达到完全缓解,有功能正常的骨髓,母细胞少于5%,而每位患者对治疗都会有不同的响应,并有可能存在具有临床显着性的微小残留病变(MRD),我们需要了解这些微小残留病变,因为它可能会导致复发,MRD监测是急性白血病和其它癌症中的一个快速新兴的领域。Tracy专注于混合谱系白血病
研究揭示玉米花药减数分裂期特异表达24-nt phasiRNA对甲基化的功能
PhasiRNA(phased, secondary, small interfering RNA)在植物的生长、发育、生殖以及抗病过程中发挥重要作用。在玉米花药发育过程中,有两类phasiRNA大量产生:一类是在细胞增殖分化期大量产生的21-nt phasiRNA,另一类是在减数分裂期大量富集的24-nt phasiRNA。已有研究发现,玉米多
研究揭示DNA去甲基化与阿尔茨海默病病变之间的关联
阿尔茨海默病(Alzheimer Disease,AD)是一种与衰老密切相关而复杂的多因素疾病,其发病机理较复杂。AD主要的神经病理特征为β-淀粉样蛋白沉积形成斑块和微管蛋白tau过度磷酸化形成神经纤维缠结。学界研究之前的AD病人脑组织样本和模型小鼠,发现在AD神经元退行性病变过程中存在明显的表观调控改变和功能失调,包括DNA甲基化和去甲基化。作