Molecular Cell:基因组所RNA甲基化表观遗传新机制研究获重要进展
11月21日,中国科学院北京基因组研究所重大疾病基因组与个体化医疗实验室 “百人计划”研究员杨运桂研究组,与美国芝加哥大学何川教授实验室和奥斯陆大学Arne Klungland教授合作完成的“RNA甲基化表观遗传新机制研究项目”取得重要进展,相关学术论文在Cell子刊 Molecular Cell 杂志以 ALKBH5 is a Mammalian RNA Demethylase that Imp
Mol Cell:DNA甲基化预测机体衰老程度
2012年11月21日 讯 /生物谷BIOON/ --在一项新研究中,美国加州大学圣地亚哥医学院研究人员描述了一种新的标记物,并利用新的模型在基因和分子水平来量化老化发生程度,新研究不只是提供一个更精确的方法来确定人的衰老程度,同时也或许提出了预见或治疗疾病的方法。该研究结果发表在11月21日的Molecular Cell杂志上。
Nat Struc & Mol Biol:杨财广等揭示核酸去甲基化酶识别碱基损伤的分子机制
最近,中科院上海药物研究所杨财广课题组等在Nature Structural and Molecular Biology等期刊上发表研究论文,揭示核酸氧化酶识别甲基化碱基损伤的分子机制。 2002年有研究发现,大肠杆菌AlkB蛋白利用催化氧化去甲基化的反应机理对核酸碱基上的烷基化损伤进行修复,实现调控烷基化试剂对细菌的伤害。这一发现掀起了该领域的研究热潮。
Nature:阐明一种独特的DNA甲基化模型
3月28日,哈佛-麻省理工博德研究所的Alexander Meissner等人在Nature在线发表了一篇名为“A unique regulatory phase of DNA methylation in the early mammalian embryo”的文章,阐明了哺乳动物胚胎早期一种独特的DNA甲基化模型。 DNA甲基化是高度活跃于哺乳动物胚胎形成期。
Genome Res:新方法让甲基化分析不再受限于材料
对于基因组水平的DNA甲基化研究,您有好几种方法可以选择,比如,全基因组亚硫酸氢盐测序。这种方法带来了高分辨率且全面的甲基化模式检测,但它需要大量的起始材料。在构建文库时,通常需要5μg以上的基因组DNA。因此,对于起始材料有限的样本,这种甲基化分析方法不适用。 相比之下,低代表性的亚硫酸氢盐测序需要的起始DNA要少一些,但同时牺牲了全面性。与分析整个基因组不同,这种方法聚焦于基因组的特定区域。
Sci Signal:靶向VEGFR-2甲基化过程控制癌症血管生成
JBC:赖氨酸甲基化负调节IFITM3的抗病毒功能
SET7介导的第88位赖氨酸甲基化负调节宿主限制因子IFITM3的抗病毒功能。(A)串联亲和纯化策略。(B)IFITM3第88位赖氨酸单甲基化受VSV感染诱导并受干扰素α处理抑制。(C)IFITM3与SET7的内源性相互作用受VSV感染上调,并受干扰素α处理下调。(D)只有在IFTIM3表达存在下,基因沉默SET7才会影响VSV感染。
比较远古与现代人的甲基化图谱
对远古DNA进行测序已经帮助科学家们了解将现代人与他们已灭绝的最近亲族尼安德特人与丹尼索瓦人分开的遗传改变;如今,据一项新的报告,科学家们也已经更好地理解了表观遗传学是如何影响这些群组之间的差异的。表观遗传学调控可改变基因的表达方式,但它并非通过改变基础的DNA序列,而是通过包括DNA甲基化等过程来影响基因的。
Nature:修饰酶的顺序甲基化
RNA经历很多类型的转录后修饰。其中的一个类型是rRNA的2′-O-ribose的甲基化。修饰酶(box C/D核蛋白复合物)利用可识别两个甲基化点的guide RNA来识别其目标。 Teresa Carlomagno及同事确定了结合到基质RNA上的390 kDa archaeal复合物的结构。这项工作显示,两个“甲基化引导序列”存在于不同情境中,这种情况有利于在两个点上进行的顺序甲基化。
MOL CELL:精氨酸的甲基化修饰参与调控细胞自噬的活性
2013年10月22日,张宏课题组在《Molecular Cell》杂志在线发表题为“Arginine Methylation Modulates Autophagic Degradation of PGL Granules in C.elegans”的论文。