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新冠患者病毒存在快速进化风险,需更多序列追踪进化

 新冠病毒的进化速度、病毒与被感染者肺中其他微生物互动的方式,目前尚不清楚。近日,国际学术期刊《临床传染病》(Clinical Infectious Diseases)刊发了来自中国研究团队的学术论文:新冠病毒在患者体内的基因多样性(Genomic diversity of SARS-CoV-2 in Coronavirus Disease 201

2020-03-09

新研究揭示它可导致大量不想要的DNA重复

2020年2月26日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自德国明斯特大学的研究人员发现,在小鼠进行常规的CRISPR-Cas9基因插入过程中,不必要的DNA重复频率很高。相关研究结果发表在2020年2月21日的Science Advances期刊上,论文标题为“Pervasive head-to-tail insertions of DNA te

2020-02-26

Nat Neurosci:DNA重复元件维持神经元功能

我们基因组的一半以上由DNA中的重复元件组成。在极少数情况下,这些重复序列会变得不稳定并发生扩增。这些重复元件的“扩增”会导致神经退行性疾病,例如ALS和痴呆症,以及脆弱X综合征和自闭症等的发生。

2020-02-19

新冠病毒的基因组序列分析

2月3日,《自然》在线发表论文介绍了上海公共卫生临床中心和复旦大学公共卫生学院教授张永振等人对2019-nCov的基因组序列的分析。该病毒基因组从就职于出现首批患者的海鲜市场的一名病人身上获得。基因组分析显示,该病毒与此前在中国蝙蝠体内找到的一组SARS样冠状病毒密切相关。最近出现在武汉的一种2019-nCov已传播到中国其他地区和其他几个国家,其中包括美国

2020-02-07

研究提出环形RNA内部序列结构可视化新方法

近期,中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队于Bioinformatics 杂志上在线刊发了题为Visualization of circular RNAs and their internal splicing events from transcriptomic data 的研究。该研究主要开发了环形RNA的可视化工具——CIRI-vis软件,具有将CI

2020-02-08

J Med Virol:最大规模的荟萃分析揭示新型冠状病毒的基因组序列特性

2020年2月9日 讯 /生物谷BIOON/ --迄今为止,对新型冠状病毒(2019-nCoV)基因组进行最大规模的测序分析结果证实,这种病毒起源于蝙蝠,且病毒的异质性较低;近日,一项刊登在国际杂志Journal of Medical Virology上的研究报告中,来自博洛尼亚大学的科学家们通过研究在病毒的蛋白质中鉴别出了一种高度可变的基因组热点区域,该区

2020-02-08

国家基因组科学数据中心首次公开新型冠状病毒全基因组序列

国家基因组科学数据中心(NGDC)信息显示,1月26日,该中心收录了由中国医学科学院/北京协和医学院病原生物学研究所提供的5株2019新型冠状病毒全基因组序列。

2020-01-30

世卫组织:中国已分享新型冠状病毒基因序列信息

 世界卫生组织12日宣布,已收到中国分享的从武汉不明原因病毒性肺炎病例中检测到的新型冠状病毒基因序列信息。世卫组织还表示,不建议对中国实施任何旅行或贸易限制。世卫组织在一份声明中说,12日已从中国国家卫生健康委员会获得更多有关武汉不明原因病毒性肺炎的详细信息,包括从病例中检测到的新型冠状病毒基因序列信息,这对其他国家开发特定诊断工具有重要意义。世卫

2020-01-14

Nat Biotechnol:DNA重复片段——基因组中的“黑物质”

2019年11月25日 讯 /生物谷BIOON/ -- 基因组的大部分区域由重复片段组成。这些“ DNA重复序列”在错误位置的扩增可能会产生严重后果。然而,DNA重复序列的扩增非常难以分析。柏林马克斯·普朗克分子遗传学研究所的研究人员最近开发的一种方法可以详细查看这些以前无法进入的基因组区域。它结合了纳米孔测序,干细胞和CRISPR-Cas技术。该方法可以改善未来各种先天性疾病和癌症的诊断。&nb

2019-11-25

CAG重复序列决定着亨廷顿舞蹈病发病时间

2019年8月15日讯/生物谷BIOON/---亨廷顿舞蹈病(Huntington's disease, HD)是一种遗传性的致命性疾病。在这种疾病中,大脑中的神经细胞随着时间的推移而遭受破坏。它在生命中的任何时候都可能变得明显,但通常开始于一个人的三四十岁。在一项新的研究中,来自亨廷顿舞蹈病基因修饰物联盟(Genetic Modifiers of Huntington’s Disease Con

2019-08-15