人类原发性癌症染色质可接近性图谱揭示DNA-蛋白结合与癌症发生存在着关联
2018年10月27日/生物谷BIOON/---癌症是世界范围内死亡的主要原因之一。尽管2％的编码蛋白的人类基因组已被广泛研究，但是关于癌症中的非编码基因组（占人类基因组的98%）和基因调控，仍然有很多是未知的。通过转录因子（transcription factor, TF）作用于分散在非编码基因组中的发挥着长程影响的DNA调节元件，基因在适当的细胞类型和细胞状态中打开和关闭。癌症基因组图谱（Th
新研究发现肠道和大脑通过迷走神经直接连接在一起
2018年9月23日/生物谷BIOON/---人类大脑通过电信号接收来自五种感官---触觉、视觉、听觉、嗅觉和味觉---的信息。这些电信号沿着皮肤和肌肉下面的长长的神经纤维进行传输。人体肠道上排列着1亿多个神经元---它实际上就是一个大脑。确实，肠道实际上与大脑之间存在着交谈。之前的研究已发现涉及消化系统和中枢神经系统之间信号传递的肠道-大脑连接（gut-brain connection）是以激素
模式硅藻的蛋白质组精细图谱完成
硅藻是一类重要的单细胞光合真核生物，分布广泛，提供了地球上约20%的初级生产力，对整个地球生物圈意义重大。三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)是海洋硅藻的模式生物，其基因组序列于2008年公布，但目前基因组的注释仍很不完善。蛋白基因组学(Proteogenomics)是利用蛋白质组学数据，尤其是高精度的串联质谱数据，结合基因组和转录组
Nature子刊：非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破
近日，匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归（Elastic Net regression）的机器学习模型，从1，001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱（long noncoding RNAs， lncRNAs）与265种抗癌药物敏感性数据中，挖掘出了27，341对lncRNA-药物可预关联（lncRNA-drug predictiv
科学家揭示CRISPR/Cas9切口全新连接机制，未来有望实现精准连接
从2013年张锋[1]和George Church[2]第一次使用CRISPR-Cas9编辑人体细胞算起，这项技术在人体细胞中的使用已经走过5个年头。虽然CRISPR被科学家使用的很溜，并已经走到临床试验阶段；但我们对Cas9的切割原理和切割后细胞修复机制的了解还比较少，甚至可以说它们还是个黑盒子。前不久，上海交通大学吴强教授课题组在Molecular Cell上发表了一篇文章，他们发现Cas9切
研究发现脑功能连接能预测抗精神病药物治疗首发精神分裂症的疗效
近期研究发现，重性精神疾病，包括精神分裂症和情感障碍，在首次发作后病情逐步加重，而重复多次发作会引起大脑不可逆的变化。因此尽早对病人明确诊断、并进行有效的治疗，将减少发作、缓解病情加重的趋势，临床意义重大。近二十年来，核磁共振成像（MRI）技术的快速发展，为找到精神分裂症的生物学指标提供了独特的机会。同时运用先进的机器学习技术，研究者们已经能对精神分裂症进行更加客观的诊断。
首次构建出哺乳动物单细胞染色质可接近性图谱
2018年8月26日/生物谷BIOON/---科学家们对DNA缠绕和包装到所谓的染色质中的方式感兴趣，这是因为这会影响每个细胞中可用到的遗传信息。DNA就像串在一根绳子上的念珠。在这些分子“念珠”移动的地方会有空间形成，这样蛋白就能够访问和“读取”遗传信息。这种状态或者说这种基因组特征就是染色质可接近性（chromatin accessibility, 也译作染色质开放性）。在一项新的研究中，来自
Cell：科学家有望成功绘制出人类大脑神经系统详细图谱 或能阐明多种神经性疾病的发生根源
2018年8月21日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Cell上研究报告中，来自瑞典卡罗琳学院的研究人员通过研究绘制出了小鼠神经系统中多种细胞类型的系统且全面详细的图谱，该图谱或能为研究人员提供揭示机体神经性疾病起源的线索，此外，研究人员还能利用相同的方法来绘制出关于人类大脑的详细图谱。图片来源：CC0 Public Domain大脑神经系统中含有上千种不同类型的神经元细胞、
首个肺癌全息细胞图谱问世
肺癌是发病率和死亡率增长最快，对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一，治愈起来较为困难，而且近年来肺癌患者有年轻化的趋势。虽然目前科学家在肺癌治疗方面取得了巨大的进展，但对其细胞层面上的科学认识仍难尽如人意。近日，著名学术期刊《Nature Medicine》重磅推出了史上最完整的肺癌细胞图谱！这将是科学家们在细胞层面深入了解肺癌真相的最佳契机！来自鲁汶大学等机构的研究人员通过对数以千计的健康与癌
Cell：利用CRISPRi技术绘制人细胞中的基因相互作用图谱
2018年7月22日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国加州大学旧金山分校的研究人员使用一种基于CRISPR的高通量技术快速地绘制人细胞中将近500个基因的功能图谱，其中的许多基因之前从未被详细地研究过。相关研究结果于2018年7月19日在线发表在Cell期刊上，论文标题为“Mapping the Genetic Landscape of Human Cells”。这项研究产生了大