研究开发出基于深度学习的单细胞转录组分析模型
单细胞转录组作为单个细胞的特征，可更加精确地定义细胞的类型。常规的基于单细胞转录组的分类方法首先是进行无监督的聚类，然后根据每个集群（Cluster）特异表达的细胞标记基因来对集群进行标注。虽然基于无监督的分类方法更容易发现新细胞类型，但是人工标注的过程费时费力。目前已有的基于监督学习的自动分类方法，大部分无法兼顾到方法的可解释性以及
Science子刊：转录因子STAT5持续激活可提高CAR-T细胞的抗肿瘤免疫反应
2020年11月6日讯/生物谷BIOON/---使用嵌合抗原受体（CAR）T细胞（CAR-T）的过继性细胞疗法显示出强大的抗肿瘤免疫力，但T细胞衰竭可能损害它们的疗效。多功能性CD4+ T细胞的存在通常与良好的抗肿瘤免疫力有关。科学家们之前发现IL-7处理可诱导产生多种细胞因子的多功能性CD4+ T细胞激活。在一项新的研究中，来自美国奥古斯塔大学等研究机构的
多篇文章聚焦科学家们在转录因子研究上取得的新成果！
本文中，小编整理了科学家们近年来在转录因子领域研究上取得的新进展，分享给大家！图片来源：Maria Schumacher, Duke University【1】Nature解读！细胞中转录因子与错配DNA强烈结合的分子机制！doi：10.1038/s41586-020-2843-2日前，一篇发表在国际杂志Nature上题为“DNA Mismatches Re
细胞中转录因子与错配DNA强烈结合的分子机制！
2020年10月26日 讯 /生物谷BIOON/ --日前，一篇发表在国际杂志Nature上题为“DNA Mismatches Reveal Conformational Penalties in Protein-DNA Recognition”的研究报告中，来自杜克大学等机构的科学家们通过研究发现，转录因子可能会无意中锁定DNA中所发生的错误。转录因子蛋白
研究揭示抗铝毒转录因子STOP1的SUMO化调控机制
10月21日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心研究员黄朝锋研究组在Plant Cell上在线发表题为Regulation of Aluminum-Resistance in Arabidopsis Involves the SUMOylation of the Zinc Finger Transcription Fac
研究揭示天然反义转录本调控microRNA生物合成和植物抗热性机制
近期，中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员何玉科研究组在Nature Communications上，发表题为Natural antisense transcripts of MIR398 genes suppress microR398 processing and attenuate plant thermotoler
研究揭示细菌Class III转录激活机制
9月28日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心合成生物学重点实验室研究员张余课题组在Nature Chemical Biology上，在线发表题为CueR activates transcription through a DNA distortion mechanism的研究论文，主要研究细菌Class III转录因子CueR转录激活的分子机制。大约50年
Nat Immunol：转录因子BATF3改善CD8+ T细胞存活和免疫记忆
2020年10月6日讯/生物谷BIOON/---当人体受到病原体感染后，它通常会启动一连串的反应，其中免疫系统中称为T细胞的特定细胞会在淋巴结中被激活，随后发生分裂和增殖。与此同时，这些细胞将获得某些使得它们能够摧毁其他细胞（比如被病毒感染的细胞）的功能。此外，它们还能产生某些蛋白，即所谓的细胞因子，从而阻止病原体的繁殖。德国维尔茨堡大学系统免疫学研究所的W
Science特刊从转录组角度专注于人体遗传变异
2020年9月21日讯/生物谷BIOON/---人类表型的全貌源自常见和罕见的遗传变异的混合，其中的一些遗传变异会影响基因在体内的表达和剪接方式。十多年前，科学家们为了更好地了解遗传多样性对健康人体的影响，发起了基因型-组织表达（Genotype-Tissue Expression, GTEx）联盟。在此，Science期刊公布了这个项目的第三阶段也是最后一
研究揭示miR-133a的转录调控机制及其在细胞分化中的作用
9月9日，国际学术期刊Cell Death & Disease发表了中国科学院生物物理研究所卫涛涛课题组与美国Creighton大学屠亚平课题组的合作论文，这是卫涛涛课题组与屠亚平课题组长期合作所取得的又一成果。研究人员发现，miR-133a表达的上调促进了线粒体生物发生和肌细胞分化，并进一步通过“定向染色质构象捕获”（CAPTURE）技术找到了调控