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地钱中TCP家族转录因子活性与染色质三维构象变化相关

  基因组学的研究不应止步于从基因组序列或表观遗传修饰中获得信息,深入挖掘三维染色质折叠对于了解基因组功能同样至关重要。近十年来,高通量测序技术的进步和高分辨率成像技术的发展使得基因组复杂的三维结构组织形式日益清晰的呈现在人们眼前。其中,利用Hi-C(high-throughput chromosome conformation capt

2020-09-11

茉莉酸信号通路转录调控机理研究获进展

激素在植物生长发育和对环境适应性的调控中发挥重要作用。茉莉酸、生长素、赤霉素、水杨酸等植物激素的受体定位于细胞核内,与转录调控紧密偶联。因此,解析激素信号介导的转录调控网络对于理解植物激素信号的动态响应过程及作用机理具有重要意义。转录中介体(Mediator)是真核生物中高度保守、由多个亚基组成的蛋白复合体,在转录调控中发挥调控作用,被称为真核生物基因转录的

2020-08-16

《细胞》亮点:庄小威联合团队看清染色质转录动态;单细胞测序揭示肺癌难根治原因

 顶尖学术期刊《细胞》在线发表了多篇论文。第一篇论文来自哈佛大学庄小威教授与Bogdan Bintu教授的联合团队。科学家们开发了一种全基因组范围内的成像技术,能够看清染色质的3D结构与转录活性。研究人员们在摘要中指出,染色质的3D结构调控了许多基因组的功能。如果有一款工具能够看清染色质的3D结构,无疑将帮助我们更好地理解其生理功能。为此,研究人员

2020-08-22

研究揭示植物体细胞胚发生的转录调控等级网络

  8月4日,国际学术期刊Developmental Cell在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员王佳伟研究组的研究论文。体细胞胚发生是指植物体细胞在特定诱导条件下,再生为胚胎并进而发育成为独立个体的过程。它是现今创制转基因作物的主要方式。体细胞胚发生的分子机理是《科学》评选的全世界最前沿125个科学问题之一,对于理解植物细

2020-08-11

研究揭示小鼠基态多能干细胞的转录调控新机制

添加MEK和GSK3抑制剂(PD0325901、CHIR99021)的无血清培养基条件(2i+Lif, 2iL)下的小鼠胚胎多能性干细胞比传统血清条件(serum+Lif, SL)下的胚胎多能性干细胞更接近着床前胚胎的内细胞团,因此2iL条件下的胚胎多能性干细胞又被称为基态多能干细胞,具有更高的分化潜能,而SL条件下的胚胎多能性干细胞则被称为亚稳态多能干细胞

2020-08-06

研究揭示植物体细胞胚发生的转录调控等级网络

8月4日,国际学术期刊Developmental Cell在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员王佳伟研究组的研究论文。体细胞胚发生是指植物体细胞在特定诱导条件下,再生为胚胎并进而发育成为独立个体的过程。它是现今创制转基因作物的主要方式。体细胞胚发生的分子机理是《科学》评选的全世界最前沿125个科学问题之一,对于理解植物细胞的全能性具有重要理论意

2020-08-06

颜宁团队利用单粒子冷冻显微镜成功揭示嵌入到脂质体中的膜蛋白的精细化结构!

2020年7月29日 讯 /生物谷BIOON/ --离子通道蛋白和膜转运蛋白的作用是在细胞膜上移动离子和小分子,其对于细胞代谢和稳态的维持非常必要,同时还能作为机体多种生物性的信号通路,研究人员认为,这两类蛋白对于机体健康极其重要,这些蛋白的缺陷往往与多种疾病发生直接相关;为了理解特殊蛋白的缺陷为何会引发疾病,我们不仅要知道这种蛋白的作用,而且还要知道其是如

2020-07-29

Cell:从结构上揭示新冠病毒复制/转录复合物中解旋酶-聚合酶偶联机制

2020年8月2日讯/生物谷BIOON/---冠状病毒属于套式病毒(Nidovirales)目,是一类正链RNA(+RNA)病毒。这些病毒是几种人畜共患传染病的罪魁祸首。致命的事件包括2003年由SARS-CoV引起的严重急性呼吸道综合征(SARS)大流行和由MERS-CoV引起的中东呼吸道综合征(MERS)疫情。作为一种β冠状病毒,SARS-CoV-2已被

2020-08-02

Nature Communications:研究发表单细胞转录组数据检索新方法和参考数据库

 作为细胞异质性研究的重要工具,单细胞转录组测序技术近年来蓬勃发展,并积累了大量研究数据。若能有效利用现有的单细胞数据进行检索与推断,研究者便能更好地进行新测序单细胞的注释,以及综合多数据集的研究。然而,精确的单细胞转录组数据检索和注释需要克服两个挑战:一、数据集之间的批次效应(batch effect)会显着影响细胞检索的可靠性;二、目前缺少跨物

2020-07-15

研究获得青鳉胚胎发育过程中的转录及调控动态图谱

 青鳉(Oryzias latipes)是一种重要的脊椎动物模型,已经在遗传学、发育生物学以及环境科学等领域广泛应用。目前,青鳉已有高质量的基因组序列,以及大量可用的遗传学技术手段。然而,目前的青鳉基因组注释主要是基于生物信息学预测和短读长的转录组测序数据,仍然存在很多问题。低质量的基因组注释是利用青鳉作为模式动物进行组学和系统生物学研究的重要障碍

2020-07-07