Science:利用机器学习破解发育中的人类大脑中的基因调控
这项研究是作为 PsychENCODE联盟的一部分完成的,该联盟汇集了多学科团队,从人类大脑中生成大规模的基因表达和调控数据,涉及几种主要的精神疾病和大脑发育阶段。
研究揭示USP1-ATF4-CD98hc调控ENKTL淋巴瘤患者耐药的新机制
本研究表明,sEVs中的CD98hc蛋白可作为监测淋巴瘤进展和耐药的临床标志物,为靶向肿瘤来源的sEVs和sEVs中的CD98hc蛋白治疗ENKTL提供了理论依据。
EMBO:徐安龙、万刚团队合作揭示ZNFX1在病毒感知与炎症调控中的双重角色
本研究揭示了ZNFX1在病毒感知和炎症抑制中的双重作用,为治疗ZNFX1突变相关疾病提供了新的见解,即可能通过NLRP3炎症小体通路抑制剂来治疗该遗传疫病。
Science:利用单细胞染色质可及性图谱揭示原发性人类癌症中的恶性调控程序
多种人类原发性癌症类型的 TCGA 单细胞图谱和用于解释癌症中顺式调控元件的可解释深度学习模型,为了解导致原发性人类癌症恶性表型的分子程序提供了新的资源。
GEN Biotechnol:科学家识别出与侵袭性乳腺癌相关的新型基因网络
这项研究中,研究人员分析了三种主要的乳腺癌亚型,尤其强调了最具侵袭性的基底样亚型,他们发现,相比更为普遍的管腔A亚型和管腔B亚型,基因-基因之间的互作网络在侵袭性基底样乳腺癌亚型中有很大不同。
Nature | 记忆的社交维度:大脑皮层杏仁核对食物偏好记忆的调控机制
该研究通过多种实验手段,详细探讨了COApm在STFP记忆巩固中的关键作用,揭示了其通过整合社交和感官嗅觉输入,介导蛋白质合成依赖的记忆巩固机制。
Nature Genetics:基因调控的精准地图:ChIP-DIP技术开启蛋白质-DNA相互作用的新纪元
ChIP-DIP技术的出现,为基因调控的研究打开了一扇全新的大门。通过并行分析多个蛋白质-DNA相互作用,ChIP-DIP不仅显著提高了研究效率,还揭示了基因调控网络的复杂性和动态性。
Nature子刊:浙大熊旭深团队开发基于Transformer的语言模型,预测翻译调控并解析疾病变异
该深度学习模型Translatomer为领域提供了研究基因翻译调控的新工具,还为解释复杂疾病中的遗传变异提供了除了mRNA水平之外的重要机制基础。
Nature Genetics:基因调控的精准地图——ChIP-DIP技术开启蛋白质-DNA相互作用的新纪元
通过将多种蛋白质与DNA的结合关系同时映射,ChIP-DIP 为我们提供了一个全新的视角,使得研究人员可以在一个实验中并行检测多个蛋白质的DNA结合模式,从而更加全面、精确地揭示基因调控的动态变化。