三篇Science研究再掀蛋白质设计革命
这些方法机器学习在蛋白质设计中的真正开端。Baker表示,在接下来的几个月里,他的实验室将努力改进这些工具,以创造出更有活力和功能的蛋白质。
Nature:颠覆半个世纪的观点,张建之团队发现即使不改变蛋白质序列的同义突变也通常有害
在自然界这个瞬息万变的环境中,非同义突变更可能在某一些环境中达到低于近中性区的适应度,从而被自然选择所淘汰。研究团队用计算机模拟并用四个不同环境中测得的突变体的适应度数据证实了上述可能。
Nature:建立新的蛋白质从头设计方法
近期,中国科学技术大学教授刘海燕、副教授陈泉团队采用数据驱动策略,提出一条全新的蛋白质从头设计路线,相关成果2月9日以“用于蛋白质设计的以主链为中心的神经网络能量函数”为题发表于《自然》(Nature)杂志。蛋白质是生命功能的主要执行者,其结构与功能由氨基酸序列所决定。目前,能够形成稳定三维结构的蛋白质几乎全部是天然蛋白质,其氨基酸序列是长期自然
Science:利用新型人工智能软件工具RoseTTAFold仅需10分钟就可准确地计算出蛋白质三维结构
2021年7月17日讯/生物谷BIOON/---自从DeepMind在2020年的“结构预测关键评估(Critical Assessment of Structure Prediction)”(CASP14)会议上展示了该领域的显著进展以来,科学家们已经等待了数月,以获得高度准确的蛋白质结构预测的机会。现在等待已经结束。在一项新的研究中,来自美国多个研究机构
高效光致电子转移光敏蛋白质的理性设计方面获进展
CCS Chemistry发表了中国科学院生物物理研究所研究员王江云课题组、中科院化学研究所研究员夏安东课题组和植物研究所研究员于龙江课题组题为Ultrafast photo-induced electron transfer in a photosensitizer protein的研究文章。研究设计报告了可以基因编码的27 kDa
研究通过计算机蛋白质设计实现温和条件下微塑料的生物降解
塑料工业在给人类社会的生活、生产带来方便的同时,导致大量废旧塑料垃圾的产生。由于其固有的硬度、强度、耐用性及稳定性需求,废弃塑料制品无法自动降解,长期暴露对环境造成严重危害。目前,塑料垃圾的处理方式通常是填埋和焚烧,这种“生产-废弃-处理”的单向过程不符合循环经济的理念,无法从源头解决“白色污染”问题。2004年,英国普利茅斯大学教授Richard C.Th
Cell:开发出分析蛋白质-RNA互作网络的新型工具 有望开发癌症等多种疾病的新型疗法
2018年12月11日 讯 /生物谷BIOON/ --所有RNA分子在完成重要任务时都需要蛋白质作为结合伴侣,近日,一项刊登在国际杂志Cell上的研究报告中,来自德国癌症研究中心等机构的科学家们通过研究首次开发出了一种新方法,这种新方法能帮助分析细胞中完整的RNA蛋白网络的组成情况。RNA分子在细胞中能发挥重要的作用,比如信使RNA分子(mRNA)能够帮助将储存在DNA中的遗传信息翻译成为蛋白质,
驱动标志物研究的新势力:新颖的筛选策略+新一代蛋白质组学技术DIA+高级数据分析工具
pH响应型可设计蛋白质基三维微结构研究取得进展
微纳尺度的可控刺激响应生物基材料微结构对生物医药领域具有重要意义。尤其是具有精确定义的几何形貌和可重复性好的智能响应型微尺度结构与器件一直是研究热点。双光子聚合微纳加工作为一门新兴的微纳加工技术,为高精细三维微尺度结构的制备提供了有力工具,并可保证微尺度结构的几何形貌和制备可重复性。中国科学院理化技术研究所仿生智能界面科学中心有机纳米光子学实验室项目研究员郑美玲,与天津大学化工学院副教授邢金峰合作