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Science:利用新型机器学习技术准确预测蛋白和RNA的三维结构

美国斯坦福大学博士生Stephan Eismann和Raphael Townshend在该大学计算机科学副教授Ron Dror的指导下,利用巧妙的新型机器学习技术,开发出一种通过计算预测准确结构来克服这一问题的人工智能算法。最值得注意的是,即使只从少数已知结构中学习,他们的方法仍然成功,这使得它适用于那些结构最难通过实验确定的分子类型。

2021-08-28

Science:从结构上揭示产甲烷古菌的酶复合物进行电子分岔和二氧化碳固定之谜

研究人员从一种产甲烷古菌中发现了一种庞大的酶复合物,它直接将电子分岔反应中的电子转移到二氧化碳的还原和固定中。他们对这种高效的能量转化过程的详细见解可能为可持续的生物技术开发带来新的可能性。

2021-09-04

中山医学院丁俊军教授团队系统绘制相分离溶解与重建过程的染色质三维结构图谱

细胞内广泛存在相分离(Phase Separation)现象,成千上万的蛋白或核酸分子在复杂的细胞内部形成一个一个无膜“隔间”,就像油滴在水中一样,彼此互不干扰地参与细胞内如转录调控、应激、蛋白质质量控制、DNA复制等多种重要的生物学过程。1,6-己二醇(1,6-HD)是一种能够使得相分离液滴溶解的化学小分子,它是目前唯一的能同时破坏多种相的工具,所以非常有

2021-09-03

Trends in Immunology:淋巴器官成纤维细胞网状细胞和管道网络作用

不同免疫细胞群的相互协调作用可促进识别病原体或癌细胞,并能精确协调免疫激活和免疫调节之间的平衡。这种平衡的建立和维持依赖于身体内外表面信息的有效和准确传输以及不同免疫细胞群之间的信息交流。

2021-08-19

Stem Cell Rep:携带APOE4的人类星形胶质细胞或能过度供应胆固醇从而促进神经元脂筏结构的扩张及β淀粉样蛋白的产生

来自大邱庆北科学技术院等机构的科学家们通过研究在阿尔兹海默病疾病模型中,从星形胶质细胞到神经元中的胆固醇供应水平会升高,这就表明,在寻找治疗这种毁灭性的退行性疾病治疗方案时,研究人员或许需要深入探索如何调节大脑中的胆固醇水平。

2021-08-31

Nat Commun:硅藻胞外形成二氧化硅的结构证据

硅藻是一种分布广泛的单细胞微藻。它的特点是能够合成由二氧化硅(SiO2*H2O)组成的精致的细胞壁。

2021-08-12

研究发现人源甲状旁腺激素受体2复合物三维结构

中国科学院上海药物研究所王明伟/杨德华团队、徐华强/赵丽华团队携手蒋华良/程曦团队,在PNAS上在线发表了研究成果Molecular insights into differentiated ligand recognition of the human parathyroid hormone receptor 2。这篇由诺贝尔化学奖得主Robert J.

2021-08-10

Nature Communications:利用工程细菌编辑功能性半互穿网络聚合物研究中取得进展

  中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所副研究员戴卓君和美国杜克大学教授游凌冲等,提出了一种全新的可模块化、多样化融合蛋白组分的活体semi-IPN的构建思路,通过微凝胶包裹植入基因线路的两种大肠杆菌。相关研究成果以Living fabrication of functional semi-interpenetrating pol

2021-08-13

有机-金属杂化体对核酸四链体-双链杂化体的选择性结合和溶液结构

核酸二级结构的形成对其在体内的生物功能起着至关重要的作用。G-四链体作为一种特殊的核酸二级结构已被发现存在于基因中具有重要功能的特定区域。G-四链体的折叠和展开影响着基因表达、基因组稳定性和端粒酶活性。含有互补碱基对的富鸟嘌呤寡核苷酸序列可以形成四链体-双链杂化体(QDHs)。在脑组织和肿瘤相关基因中发现了高频率的可形成QDH的序列。G-四链体的折叠和展开的

2021-08-14

Genome Biology:科研人员开发出在单细胞中识别染色质类染色质拓扑相关结构结构的算法

  基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中,这一高级结构即三维基因组学,对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获(3C),尤其是高通量技术(Hi-C,ChIA-PET)的发展推动了三维基因组的研究,发现了包括染色质拓扑相关结构域(TAD),染色质环等一系列层次化的结构特征。近年来,单细胞水平下的Hi-C研究成为三维

2021-08-02