Science:利用FLSHclust新算法发现188种新的CRISPR/Cas系统
微生物序列数据库包含大量有关酶和其他可用于生物技术的分子的信息。但近年来,这些数据库已经变得非常庞大,以至于很难有效地搜索到感兴趣的酶。
2023-11-30
Nature Genetics | BANKSY:革命性算法,重塑空间组学数据分析
随着生物技术的快速发展,空间组学数据的产出呈现爆炸式增长,传统的数据分析方法已难以满足研究的需求。BANKSY算法的开发旨在解决这一问题。
2024-03-05
单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。
2024-02-21
Nature methods | 从序列到结构:探索CombFold组装算法的三重奏
CombFold能够有效地预测出大型蛋白质复合体的三维结构,即使是对于那些由多个不同亚基构成、结构复杂度高的复合体也同样适用。
2024-02-13
研究提出空间细胞类型组分解析新算法
生物体由各种类型的细胞组成。生物系统的结构功能和动态变化很大程度取决于细胞的空间分布,揭示和利用其规律对探索生命现象和探究疾病进化机制具有重要意义。
2023-08-15
科研人员开发估算祖先细胞群体大小的算法TarCA用于揭示早期细胞命运决定
该研究开发的TarCA算法可对任意细胞群体估计祖先细胞数目,而无需事先获得祖细胞的先验信息,也能推算少数细胞中的驱动基因,以此来预测早期细胞命运的分化倾向。
2024-03-18
Nature重磅:斯坦福大学开发AI算法,衡量人体各个器官衰老,进而预测疾病和死亡
简而言之,根据这项研究,在50岁以上的、表面看起来健康的成年人中,大约五分之一的人至少有一个器官相比于同龄人更快老化。
2023-12-07
Nature:利用新开发的 Foldseek Cluster算法一次性分析大量的蛋白结构
在一项新的研究中,来自瑞士苏黎世联邦理工学院、瑞士生物信息学研究所和韩国首尔国立大学等研究机构的研究人员通过开发一种有效的方法来比较 AlphaFold 数据库中的所有预测蛋白结构,揭示了不同物种蛋白
2023-09-27