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Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。

2024-11-10

Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。

2024-11-23

《科学》:我们对睡眠增强记忆的认知,要被颠覆了!科学家首次发现,巩固记忆的尖波涟漪竟然要消除,否则损伤记忆能力

这项研究成果改变了我们对尖波涟漪巩固记忆的认知,让我们认识到,在睡眠期间不仅有促进记忆形成的尖波涟漪,还有平衡现在与未来记忆需求的BARRs。二者中的任何一个受损,都会损伤记忆。

2024-08-17

Nature | 记忆的社交维度:大脑皮层杏仁核对食物偏好记忆的调控机制

该研究通过多种实验手段,详细探讨了COApm在STFP记忆巩固中的关键作用,揭示了其通过整合社交和感官嗅觉输入,介导蛋白质合成依赖的记忆巩固机制。

2024-07-10

Nat Cancer:王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨率空间原位蛋白图谱,揭示肝细胞癌微环境空间异质性

利用CODEX技术,研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色,分辨率达0.377 μm/pixel,一共获得了4,347,731个细胞,定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。

2024-10-03

Neuron丨氯胺酮通过消除VTA支配的BLA记忆细胞中的创伤记忆改善创伤后社交回避

在这项研究中,团队应用了活动依赖性的细胞标记技术对BLA中的记忆细胞进行标记和操控,结合光遗传学和化学遗传学工具调控VTA-BLA神经回路。

2024-07-21

Cancer Cell丨毛开睿团队空间解析肿瘤抑制性免疫微环境

这项研究揭示了肿瘤抑制性免疫微环境的空间组织结构、驱动其形成的分子机制及其相应的生理功能。

2024-07-20

研究发现记忆B细胞再分化调控机制

该研究发现了记忆B细胞再分化命运调控的分子机制,首次提出了表观遗传进行性记录每一个B细胞及其后代的免疫刺激史,进而影响细胞命运决定过程的理论。

2024-07-24

研究揭示我国被子植物灭绝风险的空间格局及驱动因素

该研究首次展示了我国被子植物灭绝风险的空间聚集性和驱动因素的尺度依赖性,强调了生物多样性保护的复杂性和紧迫性,对于理解我国被子植物灭绝风险现状、预测生物多样性丧失趋势并制定针对性保护措施具有科学价值。

2024-08-02

空间组学数据解析肿瘤微环境的异质图学习方法

该研究提出了名为stKeep的新模型。该模型构建了三种不同节点即细胞/spot、基因和肿瘤区域以及八种连接关系的异构图模型,用于刻画肿瘤微环境。

2024-07-02