多篇文章解读科学家们在空间多组学研究领域取得的新进展！
革命性算法BANKSY或能重塑空间组学数据分析、单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得重大进展、综述文章揭示单细胞和空间组学技术在肝脏研究领域的重要进展
2024-04-30
大脑中的“园丁”与“杂草”Nature：利用空间转录组时钟揭示大脑衰老过程中的细胞邻近效应
这项研究表明，细胞之间的互动——而不仅仅是单个细胞的特性，在塑造衰老过程中起着关键作用。
2024-12-27
空间组学数据解析肿瘤微环境的异质图学习方法
该研究提出了名为stKeep的新模型。该模型构建了三种不同节点即细胞/spot、基因和肿瘤区域以及八种连接关系的异构图模型，用于刻画肿瘤微环境。
2024-07-02
Nat Cancer：王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨率空间原位蛋白图谱，揭示肝细胞癌微环境空间异质性
利用CODEX技术，研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色，分辨率达0.377 μm/pixel，一共获得了4,347,731个细胞，定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。
2024-10-03
科研人员开发基于深度学习模型的空间转录组精细分辨率细胞注释算法
STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具，在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。
2024-11-10
嘉宾日程介绍 | 徐健/祝颖慧/唐惠儒/田瑞军/赵焱邀您参加2024（第七届）多组学研究与临床转化前沿论坛
上海市免疫学研究所联合生物谷于2024年9月13日至14日在上海举办“2024（第七届）多组学研究与临床转化前沿论坛”。
2024-09-06
Nat Methods | 田鲁亦/刘晓东团队系统性评估11种空间组学技术
通过评估，不同技术方案各有优劣，并且一些国产的技术平台的指标已经达到领先，凸显了中国在这一新兴领域的快速发展趋势。
2024-07-16
Nature：儿童T细胞急性淋巴细胞白血病的多组学分析
这项研究通过分析 T 细胞急性淋巴细胞白血病的多组学数据，确定了15种亚型，并揭示了非编码区域基因组改变和增强子失调机制在疾病发展中的关键作用。
2024-09-07
Nature：首次构建出人类胸腺细胞空间图谱，揭示人体免疫反应如何在生命早期建立和维持
这项研究的一项重要成果是开发了一种名为OrganAxis的标准化高分辨率空间绘图方法，用于比较胸腺样本在不同发育阶段的组成和结构组织，其分辨率比以往任何时候都要高得多。
2024-11-26
科研团队发布黄瓜近完整参考基因组及多组学综合数据库
该研究搭建了第一个黄瓜多组学数据库Cucumber-DB（http://www.cucumberdb.com/），囊括了重要的黄瓜泛基因组、核心种质变异组和转录组数据。
2024-06-26