Blood:揭示成体巨核细胞谱系的空间和功能多样性
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)研究员王前飞研究组,首次绘制了小鼠巨核细胞的单细胞转录组图谱,揭示了体内巨核细胞在分子、空间分布及功能上的异质性,在此基础上提出了一种新的巨核细胞分类系统,而免疫巨核群体可能是一个新型造血分支。以往研究对巨核细胞功能的认识局限于产生具有止血凝血功能的血小板,而近年来的研究发现,巨核细
科学家开发一种新型微生物群体单细胞分辨率高通量空间转录组分析技术
近日,美国加州理工学院研究团队开发了一种新的高通量空间转录组成像方法——并行连续荧光原位杂交par-seqFISH(parallel sequential fluorescence in situ hybridization)技术,能够在单细胞水平鉴定和观察微生物基因表达谱和微尺度环境中的空间信息,同时利用成像系统对不同菌落核仁长度、
Nature:科学家完成单细胞分辨率下小鼠脑DNA甲基化图谱
哺乳动物脑细胞在基因表达、解剖和功能方面表现出显着的多样性,但这种广泛异质性背后的调控方式尚不清楚。近日,来自美国的科研团队在《Nature》杂志发表了题为“DNA methylation atlas of the mouse brain at single-cell resolution”的研究成果,通过单核DNA甲基化
Nature:科学家成功绘制出小鼠大脑中数百万个细胞的完整图谱!
来自加州理工学院等机构的科学家们通过研究以一种前所未有的分辨率描述了小鼠大脑中的微小基因组细节,以及如何结合多种类型的基因组学技术来实现这一分析。
Science:利用蛋白系统的多尺度图谱解释癌症突变
2021年10月1日讯/生物谷BIOON/---肿瘤基因组测序显示,除了少数常见的突变基因外,影响癌症基因组的大多数突变是罕见的。为了解释这些罕见的事件,一种强有力的方法是根据突变对常见的失去调节的细胞系统的影响来梳理突变。以这种方式理解癌症基因组需要克服两个挑战:(i)如何全面地绘制癌细胞系统?(ii)如何确定哪些系统处于突变选择之下?为了解决这些问题,来
Science:构建出乳腺癌的蛋白-蛋白相互作用图谱
这项新的研究表明系统性的蛋白-蛋白相互作用图谱为在信号通路和蛋白复合物中确定非特征性突变的背景提供了有用的资源。此类图谱不仅在乳腺癌而且在头颈癌中有效地识别了以前未识别的癌症易感基因和药物可靶向的弱点。这些努力正在为健康和患病细胞中的蛋白复合物和系统的分层图提供信息,从而可以用来为已知的抗癌疗法对患者进行分层,并推动发现癌症以及其他各种疾病的治疗靶标。
Science:头颈鳞状细胞癌的蛋白网络图谱可揭示PIK3CA突变体的药物敏感性
为了描述HNSCC的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)景观,来自美国加州大学圣地亚哥分校和加州大学旧金山分校的研究人员根据对HNSCC肿瘤进行的癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)分析所确定的分子通路改变来选择蛋白。另外的蛋白是根据存在复发性点突变的基因或以前发表的与HNSCC有关的基因添加的。
Nature Communications:绘制川崎病单细胞免疫图谱
中国科学院上海营养与健康研究所、上海市儿童医院、上海国际人类表型组研究院等合作,完成了川崎病外周血单细胞免疫图谱的绘制工作。相关研究成果以Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from acute Kawasaki disease patients为题,在线发表在Na
Science:大规模研究构建出数百种人类抗体结合SARS-CoV-2图谱,有望开发出更有效的COVID-19抗体疗法
在一项新的研究中,研究人员发布了人类抗体与SARS-CoV-2结合的详细图谱,该图谱是通过全球合作比较几乎所有领先的临床候选抗体药物产生的。这项新研究将指导开发更有效的COVID-19抗体疗法,并帮助科学家们开发有效的疫苗以应对新出现的病毒变体。