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Science:新研究开发出一种基于DNB阵列构建的空间分辨高通量单细胞转录平台

Stereo-cell建立了一个具有空间和多模式能力的高通量单细胞转录组学整合框架。该平台克服了现有方法的关键限制,提高了分析细胞间相互作用、微环境和亚细胞基因表达的可扩展性、灵活性和精确度。

2025-08-26

Nature:从基因伤痕到转录静默——单细胞多组学揭示大脑衰老的因果链条

研究为我们提供了一张前所未有的高分辨率地图,以前所未有的深度和广度,揭示了人类大脑在从婴儿期到百岁高龄的漫长旅程中,细胞层面发生的深刻变革。

2025-09-06

中国学者一作Nature论文:绘制转移性胰腺癌转录可塑性空间图谱

不同患者的原发灶与其多器官转移灶之间缺乏统一的克隆进化模式,即使在同一器官内部,也可观察到多个独立克隆亚群的共存。此外,癌细胞的谱系表型与其克隆起源无严格对应性,而是显著地与其所处的肿瘤微环境相关联。

2025-04-27

汪阳明团队创新双学技术MAPIT-seq:在单细胞水平同时绘制RNA结合蛋白作用图谱与基因表达图谱的新利器

MAPIT-seq在检测互作图谱的同时可以同步获取转录组信息,实现功能结合与表达背景的双重解析。

2025-08-17

Nature Methods:当百年病理学遇见AI——iSCALE赋能H&E图像,预测细胞空间转录

iSCALE 的诞生,为研究人员提供了一种全新的“世界观”和方法论,彻底改变了我们在大尺度上探索组织微观世界的游戏规则。

2025-09-18

Cancer Cell:复旦大学曹志伟/陈海泉团队绘制小细胞肺癌空间单细胞图谱,揭示其空间分子异质性及免疫互作生态位

该研究通过空间多组学揭示了非小细胞肺癌的肿瘤异质性和免疫微环境动态,提出了 MT2 生态位作为患者预后和免疫治疗响应的新标志,为小细胞肺癌的精准分型和治疗策略提供了重要依据。

2025-02-26

Nature Genetics:深入百万细胞宇宙——首张东亚人群单细胞多组学免疫图谱问世

这项研究不仅为理解免疫系统的运作机制提供了全新的视角,更重要的是,它为迈向真正的精准医疗时代,点亮了一盏耀眼的探路灯。

2025-08-01

Cancer Cell:黄活聪团队通过单细胞空间分析,揭示抗原呈递癌症相关成纤维细胞的“双重身份”及其空间生态位

该研究通过单细胞分辨率空间分析,揭示了抗原呈递癌症相关成纤维细胞(apCAF)包含了两个截然不同的亚群——间皮样 apCAF(M-apCAF),另一种是纤维细胞样 apCAF(F-apCAF)。

2025-10-01

Nature Methods :“等深度”模型重塑空间生物学格局!深度学习与空间转录学的完美结合

GASTON通过结合无监督的深度神经网络与可解释性算法,创新性地提出了“等深度”(Isodepth)的概念。

2025-02-01