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Science:在迄今最大规模的全基因测序数据中鉴定替换突变特征

突变特征(mutational signature,也译为突变信号、突变标记或突变签名)---在肿瘤发生过程中起作用的DNA损伤和修复过程的印记---使人们了解每名患者所患癌症的环境原因和内源性原因。

2022-04-23

Science:揭示完整人类基因中重复序列的转录和表观遗传状态

2022年4月4日讯/生物谷BIOON/---转座因子(transposable element)、重复序列扩张(repeat expansion)和重复序列介导的结构重排在染色体结构和物种进化中起着

2022-04-04

迄今最完整的人类基因测序结果公布

Science发布“Completing the human genome”重磅特刊!该特刊整期上线6篇封面文章,首次公布了人类基因组的完整序列。

2022-04-03

Cell Reports小鼠胚胎早期内耳神经节单细胞转录及其发育轨迹特征分析研究获进展

Cell Reports在线发表了题为Single-cell transcriptomic landscapes of the otic neuronal lineage at multiple early embryonic ages的研究论文,该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、神经科学国家重点实验室、上海脑科学与类脑研究中

2022-03-28

Nature Biotechnology:科学家验证人类干细胞分化得到的胰岛细胞的功能、代谢及转录情况

移植来自人类多能干细胞的胰岛细胞是一种潜在的糖尿病治疗方法。现阶段尽管在诱导干细胞分化的胰岛细胞(SC-islets)取得了进展,但对其功能特性尚未进行深入研究。芬兰赫尔辛基大学研究团队对干细胞分化得到的胰岛细胞从功能、代谢和转录情况等多个方面进行了全面评估。该研究成果于近日发表在《Nature Biotechnology》上,题为:Functional,

2022-03-21

Nature子刊:浙大团队揭示肠道细菌调控表观转录修饰促进结直肠癌转移机制

结直肠癌是常见恶性肿瘤之一,是全世界发病人数第三、死亡人数第二的恶性肿瘤。结直肠癌在我国同样不容乐观。尽管结直肠癌的治疗手段不断发展,但晚期转移性结直肠癌患者的预后生存仍然不理想,我们需要对结直肠癌的转移机制有更深刻的认识。近年来,随着宏基因组测序等研究手段的不断进展,人们发现肠道菌群能广泛影响宿主细胞的生理和病理功能,并揭示了多种微环境细菌能够参与结直肠癌

2022-03-15

BMC Plant Biology:小粒咖啡种质资源全基因测序解析研究获进展

   小粒咖啡(Coffea arabica)隶属于茜草科(Rubiaceae),是多年生的重要经济作物。随着特色咖啡需求增加,开发市场需求高的咖啡品种颇为重要。埃塞俄比亚作为小粒咖啡基因库的主要来源,其种质资源具有颇高的价值,可用于培养优良性状的品种。基因组重测序可以促进分子育种,且通过重测序分析产生的标记有助于推进传统作物育

2022-03-03

Nature Immunology: 转录因子家族对静息和活化T细胞表观基因的分级调控

T细胞激活是适应性免疫反应中的一个关键早期事件,受到精细的转录调控

2022-01-22

CANCER DISCOV:通过基因转录组分析揭秘转移性乳腺癌(MBC)的复发过程!

近来Philippe Aftimos教授及其团队针对乳腺癌基因展开了相关研究,旨在通过对原发肿瘤和早期转移瘤进行多组学分析,研究转移性乳腺癌(MBC)的复发过程。

2022-01-18

中山大学生命科学学院RNA学团队开发PolⅢ转录的非编码RNA功能网络信息库

中山大学生命科学学院RNA组学团队杨建华教授等开发了Pol3Base数据和信息库,系统鉴定RNA聚合酶III(PolⅢ)转录的非编码RNA(P3RNA),全面解析P3RNA的互作组、表达、进化、表观转录组、疾病变异及调控网络。Pol3Base 网站整合了由不同转录因子调控的数千个 RNA 聚合酶 III 转录的 ncRNAs 转录组数据。Pol3Base 的

2022-01-02