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Nature:AlphaFold震撼揭示98.5%人类蛋白质结构

7月22日,顶级期刊《Nature》带来了一项令科学家们振臂高呼的文章。DeepMind公司宣布旗下人工智能系统AlphaFold已经实现对98.5%已知人类蛋白质以及大肠杆菌、果蝇、斑马鱼等20种模式生物蛋白质的结构预测。更惊人的是,该系统还能够对其预测结果的置信度进行测量。也就是说,生物学家们盼了数十年,终于盼来了一个“给力”的科研“外挂”。蛋白质是构成

2021-07-23

感染变形虫的巨病毒也能将它们的DNA组装成类似核小体的结构

2021年7月30日讯/生物谷BIOON/---对于一些巨病毒(giant virus)来说,一种DNA包装技巧可能对它们的感染性至关重要。称为Marseilleviridae的变形虫感染病毒(Amoeba-infecting virus)将它们的DNA缠绕在它们自己编码 的组蛋白上,就像线轴上松散地包裹着的线。在一项新的研究中,美国霍华德-休斯医学研究所研

2021-07-30

Nature:利用人工智能系统Alphafold发布最完整的预测人类蛋白质三维结构数据库

2021年7月24日讯/生物谷BIOON/---2021年7月22日,DeepMind宣布与欧洲分子生物学实验室(EMBL)合作,为人类蛋白质组的预测蛋白质结构模型建立迄今为止最完整、最精确的数据库。这将涵盖人类基因组所表达的全部约20000种蛋白质,并且这些数据将免费向科学界公开提供。该数据库和人工智能系统为结构生物学家提供了探究蛋白质三维结构的强大的新工

2021-07-24

Genome Biology:研究解析马里亚纳海沟最深沉积物完整生物圈结构并分离其微生物

   Genome Biology在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心中科院合成生物学重点实验室研究员李轩课题组和上海海洋大学教授方家松研究组、复旦大学教授南蓬研究组合作完成的题为Revealing the full biosphere structure and versatile metabolic function

2021-07-22

Science:利用新型人工智能软件工具RoseTTAFold仅需10分钟就可准确地计算出蛋白质三维结构

2021年7月17日讯/生物谷BIOON/---自从DeepMind在2020年的“结构预测关键评估(Critical Assessment of Structure Prediction)”(CASP14)会议上展示了该领域的显著进展以来,科学家们已经等待了数月,以获得高度准确的蛋白质结构预测的机会。现在等待已经结束。在一项新的研究中,来自美国多个研究机构

2021-07-17

Nature Communications:RNA二级结构测序新技术解析Dicer结合与切割底物的RNA结构基础

  RNA结构是RNA的调控与功能的基础。过去科学家们使用X-ray晶体衍射、NMR、冷冻电镜等生物物理的手段,解析了许多RNA三维结构,揭示了RNA发挥不同功能的结构基础。随着二代测序技术的发展,研究者结合化学修饰与高通量测序开发了许多高通量探测全转录组RNA二级结构的技术,并应用于RNA结构与RNA相关调控的功能研究中,揭示出RNA结

2021-06-28

Nature Plants:研究揭示绿藻光合作用状态转换调控的超分子结构基础

  绿藻是水体和土壤中常见的光合生物,作为有机物的原初生产者在生态系统中发挥重要作用。它们具有和植物相似的两个光系统——光系统I(PSI)和光系统II(PSII),通过捕光复合物I和II(LHCI和LHCII)吸收光能并将能量传递给两个光系统,完成光驱动的电子传递和能量转换过程。在光照条件多变的自然环境中,光能在两个光系统之间的分配可能不

2021-07-10

90后吴建平解析精子阳离子通道复合物三维结构

受精是精子和卵子的结合,是孕育新生命的基本的生物学过程。精子阳离子通道(CatSper)是精子运动和生育所必需的。受精过程中的几个关键步骤,包括精子超激活、顶体反应和精卵融合,都受到Ca2+信号的调节。精子特异的阳离子通道CatSper主要定位于成熟精子鞭毛的主体部分,负责受精过程中多种依赖Ca2+的生理反应。CatSper介导的Ca2+信号启动酪氨酸磷酸化

2021-07-12

Nature Plants:研究揭示组装因子Psb28调控光系统II组装修复的结构基础

  光系统II(Photosystem II,PSII)是位于放氧光合生物类囊体膜上的重要膜蛋白质机器,利用光能将水裂解为质子和电子,并放出氧气。具有光合放氧功能的PSII核心复合体是由20个蛋白亚基(17个跨膜蛋白和3个外周蛋白)、锰簇、非血红素铁、色素、质体醌(QA和QB)分子等多个辅助因子组成的色素膜蛋白复合体。PSII在体内的组装

2021-07-06

研究揭示自噬受体Nbr1识别货物的分子和结构机制

  中国科学院生物物理研究所研究员叶克穷课题组和北京生命科学研究所研究员杜立林课题组合作在The EMBO Journal上,发表了题为Molecular and structural mechanisms of ZZ domain-mediated cargo selection by Nbr1的研究成果。该研究发现了裂殖酵母自噬受体N

2021-06-28