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全基因组测序揭示喀斯特植物适应性进化机制

中国南方喀斯特起源古老、分布广泛。该地区气候温和、水分充足,广泛分布的峰林、峰丛、溶洞、天坑等复杂的地貌形态形成独特的岛屿化生境,被认为是生态与进化研究的“天然实验室”。经过漫长的演化,华南喀斯特地区孕育了高度的物种多样性和特有性。喀斯特植物是我国植物多样性和特有性的重要组成部分,但迄今为止对喀斯特植物的多样性起源和适应性进化的理解还非常缺乏。全基因组复制(

2020-04-17

对SARS-CoV-2的广泛测序或有望遏制疾病大流行

2020年4月17日 讯 /生物谷BIOON/ --研究者Peter Thielen和Tom Mehoke花费了多年时间对流感病毒的基因组进行测序研究,如今,随着新型冠状病毒(SARS-CoV-2)在全球范围内传播,这些来自约翰霍普金斯应用物理实验室(APL)的生物学家们也开始将它们研究的重点转移到SARS-CoV-2上了。图片来源:pressenza.co

2020-04-17

对40种病毒变体基因测序,冰岛发现全球首例“双重感染者”

据冰岛国家广播公司网站3月24日报道,冰岛德科德基因公司的主管卡里·斯特凡松近日在接受新闻采访时说,到目前为止,该公司已经对冰岛新冠肺炎检测中发现的大约40种新冠病毒变体进行了基因测序,并发现有一人同时感染了两种新冠病毒变体。他在采访中说,这些变体似乎仅在冰岛出现。这种病毒极强的变异性也表明,病毒可能从许多不同的国家进入冰岛,其来源地区的数量比此前所认为的更

2020-03-30

诺禾致源发布高通量测序领域首个多产品柔性智能交付平台Falcon

2020 年3月19日,,诺禾致源公司正式宣布面向全球推出高通量测序(NGS)领域首个多产品并行的柔性智能交付平台 Falcon。此次多产品柔性化智能产线的发布,突破了传统的 NGS 测序方式。同时,伴随智能交付平台的投产使用,也将有助于进一步定义行业内 NGS 测序标准,推动行业生态健康有序的发展。并为客户提

2020-03-19

Nat Biotechnol:将CRISPR/Cas9与纳米孔测序相结合实现靶向测序

2020年3月8日讯/生物谷BIOON/---为了寻找对人类基因组进行测序并读取DNA关键变化的新方法,来自美国约翰霍普金斯大学医学院的研究人员在一项新的研究中成功地使用了基因切割工具CRISPR在较长的肿瘤基因周围进行了DNA切割,以用于收集序列信息。他们在来自人类乳腺癌细胞和组织的基因组中进行概念验证实验。相关研究结果近期发表在Nature Biotec

2020-03-08

安捷伦基因组学系列讲座:安捷伦最新二代测序建库方案,攻克 FFPE、液态活检等复杂样本的难题答疑

随着样本量增加,高通量测序平台,如 NovaSeq 被越来越多的采用,而标签跳跃问题、样本标签数目限制混样数量等问题也随之而来。而随着精准医疗的发展,肿瘤样本,特别是FFPE样本、液态活检样本的测序需求越来越大,但建库环节、PCR环节、测序本身的错误率,以及前面提到的标签跳跃问题都限制了低频变异的检出,给测序服务与产品的开发带来难题。

2020-03-11

中信湘雅联合真迈生物首次发表基于国产单分子测序平台的微量细胞研究成果

近日,由中信湘雅生殖与遗传专科医院(以下简称“中信湘雅”)林戈课题组和深圳市真迈生物科技有限公司(以下简称“真迈生物”)联合组成的研究团队在预印本服务网站BioRxiv在线发表了题为Accurate CNV identification from only a few cells with low GC bias in a single-molecule s

2020-02-17

安捷伦基因组学系列讲座:安捷伦最新二代测序建库方案,攻克 FFPE、液态活检等复杂样本的难题

随着样本量增加,高通量测序平台,如 NovaSeq 被越来越多的采用,而标签跳跃问题、样本标签数目限制混样数量等问题也随之而来。而随着精准医疗的发展,肿瘤样本,特别是FFPE样本、液态活检样本的测序需求越来越大,但建库环节、PCR环节、测序本身的错误率,以及前面提到的标签跳跃问题都限制了低频变异的检出,给测序服务与产品的开发带来难题。

2020-02-21

我国科学家开发出转录组快速建库新方法 有望助力新型冠状病毒测序

北京大学与清华大学联合课题组近期在国际权威学术期刊《美国科学院院刊》发表论文,称开发出了名为“SHERRY”的转录组测序快速建库新方法。研究团队表示,这种方法大大简化了建库过程,不仅可用于高质量的单细胞转录组测序,对包括新型冠状病毒等样本的测序质量和速度也有望显着提升。核糖核酸(RNA)是存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。目前,RNA测序

2020-02-04

Nat Commun:干细胞、CRISPR以及基因测序共同帮助建立脑癌模型

近日,加利福尼亚大学圣地亚哥分校医学院的研究人员使用基因工程化的人类多能干细胞,创建了一种新型的癌症模型,用于体内研究胶质母细胞瘤如何随时间发展和变化。

2020-01-31