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Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。

2024-11-10

Cell:科学家识别出与致癌基因组改变发生相关的分子通路

本文研究结果揭示了中心DNA修复机制的病理性激活如何通过染色体破碎矛盾地诱发癌症基因组进化。

2024-09-15

Cell | 隐翅虫“生化武器”进化的基因组学与细胞基础

研究人员通过基因组组装、比较基因组学、进化树构建、细胞特异性转录组学等方法对隐翅虫的防御性腺体的分泌特征以及进化特征进行了刻画,并对隐翅虫与蚁类共生体这一高复杂性的分泌特征进行检测。

2024-07-18

Nature | 大规模结直肠癌基因组研究:寻找预后突变与治疗靶点

这项研究实现了迄今为止最大规模的结直肠癌基因组和转录组的综合分析,并将分子层面的发现与高质量的临床数据相结合,从而识别关键预后因子,这使这项研究有别于其他绝大多数癌症基因组学的研究。

2024-08-09

Nature :探索早期胚胎DNA复制,揭秘基因组不稳定性与复制时间程序

该研究利用scRepli-seq技术构建小鼠早期胚胎的全基因组DNA复制图谱,并探究DNA复制调控机制与基因组稳定性的关系。

2024-10-09

研究揭示海洋巨型单细胞多核钙化藻基因组异源多倍化与生物钙化机制

针对仙掌藻和脆叉节藻的钙化模式的差异,该研究揭示了仙掌藻胞外钙化和脆叉节藻次级细胞壁钙化的遗传调控特征。

2024-10-04

Cell:独特的三维基因组特征为治疗后窝A室管膜瘤提供潜在的新靶点

在这项研究中,这些作者仔细观察了他们可以称之为 PFA室管膜瘤细胞基因组(细胞中发现的整套 DNA 指令)的“地理位置”。

2024-07-17

Nature Genetics | 孕酮信号失调与产后出血的遗传关联:基因组大数据揭示新机制

该研究通过识别与PPH相关的遗传位点,提供了对PPH遗传机制的深入理解,并为在临床前预测PPH风险以及采取预防措施提供了潜在的分子标志物。

2024-08-01

科研团队发布黄瓜近完整参考基因组及多组学综合数据库

该研究搭建了第一个黄瓜多组学数据库Cucumber-DB(http://www.cucumberdb.com/),囊括了重要的黄瓜泛基因组、核心种质变异组和转录组数据。

2024-06-26

Nature:科学家揭示儿童T谱系急性淋巴细胞白血病发生的基因组基础

来自美国圣犹大儿童研究医院等机构的科学家们在理解T系急性淋巴细胞白血病研究上取得重大突破。

2024-08-23