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Cell:开发出空间单细胞测序技术,有助揭示早期乳腺癌产生浸润性之谜

2018年1月12日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国德州大学MD安德森癌症中心的研究人员报道一种新的遗传模型可能解释着一种常见的被称作导管原位癌(ductal carcinoma in situ, DCIS)的早期乳腺癌如何进展到更为浸润性的乳腺癌。相关研究结果于2018年1月4日在线发表在Cell期刊上,论文标题为“Multiclonal Invasion in Breast

2018-01-12

Hepatology:单细胞分析揭示肝癌遗传异质性出现的重要原因

2018年1月12日 讯 /生物谷BIOON/ --肝细胞癌是肝硬化患者死亡的主要原因,而肝癌的分子发病机制非常复杂且具有分子异质性。癌症遗传的异质性不仅表现在不同患者之间,即使是同一患者的不同肿瘤结节,甚至是同一个结节中也存在差异。肝细胞癌的分子异质性部分归因于肝癌干细胞的存在,被各种细胞表面标志物区分的不同癌症干细胞群体可能包含不同的癌症驱动基因,这就为找到分子靶向性治疗方法带来了巨大挑战。&

2018-01-12

Cell:利用单细胞RNA测序鉴定嗅觉神经元类型

图片来自Quake Lab。2017年12月3日/生物谷BIOON/---人类的神经系统就像是复杂的电路板。当电线发生交叉或者电路发生故障时,精神分裂症或躁郁症等疾病就能够产生。长期以来,科学家们一直在努力鉴定大脑回路的形成方式,以便他们能够了解让存在问题的神经元重新连接起来。如今,在一项新的研究中,美国斯坦福大学的生物学教授Liqun Luo、生物工程与应用物理系教授Stephen Quake及

2017-12-03

单细胞测序的”CPU 2.0”时代

  对单个人类细胞的基因组进行准确的变异检测和大范围单倍体型分析一直以来都是测序领域的巅峰挑战。单细胞测序使我们能在更高的分辨率下研究生命的机制。一方面,在像癌症这样的组织样本中存在大量具有不同基因组类型的单个细胞,因此需要分析单细胞水平基因组而不是大量细胞的平均值;另一方面,对于非常珍贵的细胞样品,如人类卵母细胞和循环肿瘤细胞(CTCs),单细胞测序具有无与伦比的优势;此外,

2017-11-02

利用单细胞转录组分析揭示成纤维细胞转化为心肌细胞机制

图片来自Qian Lab, UNC School of Medicine。2017年10月28日/生物谷BIOON/---在心脏病发作后,通过逆转瘢痕组织产生健康的心肌组织将会引发心脏学和再生医学领域的变革。在实验室中,科学家们已证实将心脏成纤维细胞(瘢痕组织细胞)转化为心肌细胞是可行的,但是梳理出这是如何发生的细节并不是件容易的事情,而且将这种方法用于临床实践或甚至其他的基础研究项目中一直都是难

2017-10-28

Sci Rep:利用单细胞RNA测序技术阐明机体多种类型味觉细胞的工作机制

2017年8月10日 讯 /生物谷BIOON/ --日前,一项刊登在国际杂志Scientific Reports上的研究报告中,来自美国滨州莫奈尔中心(Monell Center)的研究人员通过研究开发出了一种新技术能够鉴别出了任何味觉受体细胞的一整套基因,相关研究或能帮助研究人员阐明味觉感受器细胞发挥特殊功能的分子机制。图片来源:Monell Center研究者Sunil Sukumaran博士

2017-08-10

Nat Methods:新型基因组工具CITE-seq或能实现单细胞大规模多维度分析

2017年8月3日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Methods上的研究报告中,来自纽约基因组研究中心(NYGC)的研究人员通过研究开发了一种新技术,或能帮助推动单细胞RNA测序的进程,单细胞RNA测序是基因组研究的重要领域,其能够帮助研究人员深入解读单细胞的特性,同时还能够帮助有效区分不同的细胞类型,以及在单细胞水平下研究多种人类疾病的发病机制。图片来源:N

2017-08-02

如何让单细胞测序变得如此简单?

2017年7月20日 讯 /生物谷BIOON/ --单细胞生物学研究一直是当今的热门话题,而且最前沿的领域就是单细胞RNA测序了(scRNA-seq)。常规RNA测序方法一次性能够对成千上万个细胞进行加工测序,并给出平均差异,但并没有两个细胞是完全一样的,而新型的scRNA-seq方法就能够揭示出制造每一种特异性的微小改变,甚至这种技术还能够阐明完整的新的细胞类型。比如,当来自博德研究所的研究人员

2017-07-20

北大汤富酬课题组发表单细胞表观多组学测序技术的最新研究成果

   2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研究论文。在国际上率先发展了对一个单细胞同时进行染色质状态、DNA甲基

2017-06-22

【走进单细胞】盘点:2017单细胞扩增测序技术的最新进展

写在前面的话细胞是构成生命体的结构和功能的基本单位,不同类型的细胞形态迥异,功能也各不相同。即使是同类细胞间看似相同,相互间也存在着广泛的细胞异质性。传统的群体细胞分析检测能更快速方便的获得大量数据并利于进行有效的统计学分析,但是随着研究的深入,这种基于群体细胞分析所获得的平均性数据,往往忽略了细胞个体间的差异,在很大程度上掩盖了不少稀有、微量样本的作用以及在生命体内广泛存在的随机行为,这些“平均

2017-06-13