单细胞测序的”CPU 2.0”时代
对单个人类细胞的基因组进行准确的变异检测和大范围单倍体型分析一直以来都是测序领域的巅峰挑战。单细胞测序使我们能在更高的分辨率下研究生命的机制。一方面,在像癌症这样的组织样本中存在大量具有不同基因组类型的单个细胞,因此需要分析单细胞水平基因组而不是大量细胞的平均值;另一方面,对于非常珍贵的细胞样品,如人类卵母细胞和循环肿瘤细胞(CTCs),单细胞测序具有无与伦比的优势;此外,
利用单细胞转录组分析揭示成纤维细胞转化为心肌细胞机制
图片来自Qian Lab, UNC School of Medicine。2017年10月28日/生物谷BIOON/---在心脏病发作后,通过逆转瘢痕组织产生健康的心肌组织将会引发心脏学和再生医学领域的变革。在实验室中,科学家们已证实将心脏成纤维细胞(瘢痕组织细胞)转化为心肌细胞是可行的,但是梳理出这是如何发生的细节并不是件容易的事情,而且将这种方法用于临床实践或甚至其他的基础研究项目中一直都是难
Sci Rep:利用单细胞RNA测序技术阐明机体多种类型味觉细胞的工作机制
2017年8月10日 讯 /生物谷BIOON/ --日前,一项刊登在国际杂志Scientific Reports上的研究报告中,来自美国滨州莫奈尔中心(Monell Center)的研究人员通过研究开发出了一种新技术能够鉴别出了任何味觉受体细胞的一整套基因,相关研究或能帮助研究人员阐明味觉感受器细胞发挥特殊功能的分子机制。图片来源:Monell Center研究者Sunil Sukumaran博士
Nat Methods:新型基因组工具CITE-seq或能实现单细胞大规模多维度分析
2017年8月3日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Methods上的研究报告中,来自纽约基因组研究中心(NYGC)的研究人员通过研究开发了一种新技术,或能帮助推动单细胞RNA测序的进程,单细胞RNA测序是基因组研究的重要领域,其能够帮助研究人员深入解读单细胞的特性,同时还能够帮助有效区分不同的细胞类型,以及在单细胞水平下研究多种人类疾病的发病机制。图片来源:N
如何让单细胞测序变得如此简单?
2017年7月20日 讯 /生物谷BIOON/ --单细胞生物学研究一直是当今的热门话题,而且最前沿的领域就是单细胞RNA测序了(scRNA-seq)。常规RNA测序方法一次性能够对成千上万个细胞进行加工测序,并给出平均差异,但并没有两个细胞是完全一样的,而新型的scRNA-seq方法就能够揭示出制造每一种特异性的微小改变,甚至这种技术还能够阐明完整的新的细胞类型。比如,当来自博德研究所的研究人员
北大汤富酬课题组发表单细胞表观多组学测序技术的最新研究成果
2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研究论文。在国际上率先发展了对一个单细胞同时进行染色质状态、DNA甲基
【走进单细胞】盘点:2017单细胞扩增测序技术的最新进展
写在前面的话细胞是构成生命体的结构和功能的基本单位,不同类型的细胞形态迥异,功能也各不相同。即使是同类细胞间看似相同,相互间也存在着广泛的细胞异质性。传统的群体细胞分析检测能更快速方便的获得大量数据并利于进行有效的统计学分析,但是随着研究的深入,这种基于群体细胞分析所获得的平均性数据,往往忽略了细胞个体间的差异,在很大程度上掩盖了不少稀有、微量样本的作用以及在生命体内广泛存在的随机行为,这些“平均
可能是这些细胞不配合!科学家用病毒示踪和RNA测序精确定义了睡眠神经元
睡眠一直以来是人们比较感兴趣的研究课题,因为人的一生大约有1/3的时间是在睡眠中度过的。睡眠是每个人生命中的必需品,但它也困扰了很多人的日常生活。近几十年,随着脑电记录技术的发展,人们发现睡眠过程并不是一成不变的。从脑电的检查结果来看,正常人在睡眠时,存在两种截然不同的现象:有时眼球快速来回活动,被称作快速眼动期睡眠(REM),有时眼球不活动或者只有很慢的浮动,被称作非快速眼动期睡眠(NREM),
单细胞分析有望加速科学家对人类疾病的深度研究
近年来,随着科学家们研究的深入和细致,他们慢慢开始转向对单细胞进行精细化深度研究,比如单细胞测序技术,其能够在单个细胞水平上对基因组进行测序,相比传统的全基因组测序相比,单细胞测序不仅能够使得测定的基因表达水平更加精确,而且还能检测到微量的基因表达子或罕见非编码RNA,因此这种新型的单细胞测序技术的优势是全方位和多层次的。当然科学家们还在众多人类疾病研究领域中都应用了单细胞分析技术,本文中,小编就
张新荣教授:单细胞代谢物质谱分析
4月21日,由生物谷主办的2017多组学研究与临床转化前沿论坛在上海隆重开幕。本次会议多组学研究和临床转化研讨会以迈向临床精准医疗为主题,聚焦基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等多组学技术联用研究临床