姜红:个体化用药基因诊断行业趋势及其产品临床应用
姜红,复旦大学附属中山医院心血管内科主任医师,博士生导师。中国和德国双医学博士学位。
随着药物研发和对疾病认知的深入,尤其是随着各类组学的发展,以及新型检测技术的出现,个体化治疗日益成为临床研究的焦点。基于药物代谢酶的临床个体化用药不仅指导疾病的诊断、治疗方案的个体化决策、用药监测、甚至预后的个体化判断都起到关键作用。
CYP2C19基因检测主要针对临床使用的多种药物代谢(药物种类会随着研究的深入而增加),重点应用于氯吡格雷、质子泵抑制剂、抗真菌药物、抗抑郁和抗癫痫药物的剂量指导;ALDH2基因检测主要针对硝酸甘油和酒精代谢的指导,减少因用药无效导致的意外死亡,指导与酒精、乙醛相关肿瘤的预防;华法林敏感性基因检测主要指导医生对不同的患者决定合适、安全的剂量,降低出血并发症的风险;MTHFR基因型检测主要用于卒中及H型高血压的筛查,同时对生殖中心及妇幼系统的病因筛查和疾病预防也有重大的指导意义。
陈巍学基因23
SureSelect 定制靶向测序--陈巍学基因(23)
Agilent 公司出品的 SureSelect 定制捕获测序 Panel,是一个很好用的目标基因测序试盒。是在肿瘤靶向用药的伴随诊断上的一个先进技术手段。
许多专业的测序公司提供基于 SureSelect Panel 的定制测序服务。
本视频介绍了客户自行定制 SureSelect Panel 的方法。
GCBI 生物云平台--陈巍学基因(24)
其明公司开发的 GCBI 生物云平台,可以让生物学家方便地、自助式地进行生物信息学分析,无需特别的软件、编程专业知识。
本视频介绍了这个平台,并演示了在这个平台上,以搭积木地方式,方便地、自助式地进行分析的过程。
第一代DNA测序--陈巍学基因(25)
第一代DNA测序,是最经典的DNA测序方法。
本视频以BigDye试剂为主线,介绍了一代测序的三个最主要的技术:
Sanger先生发明的双脱氧(ddNTP)测序原理
BigDye的荧光标记方法
ABI 3500毛细管电泳分析原理
刘光慧:基于干细胞和基因组靶向编辑技术的人类疾病模型及个性化药物筛评系统
刘光慧,国家青年***入选者,中科院生物物理所研究员,生物物理所衰老研究中心秘书长、学术委员会副主任。
结合人多能干细胞和基因组靶向编辑技术,我们研究团队相继发展了人类儿童早衰症、成年早衰症、帕金森氏症、范可尼贫血症及神经胶质母细胞瘤等人类疾病的细胞模型。这些模型为揭示人类衰老相关疾病的新型机理、鉴定疾病靶标及个性化药物筛选和评价奠定了重要基础。
孙忠实:药物基因组学与β受体阻滞剂的安全性
孙忠实,主任药师,教授;曾任海军总医院药剂科主任,国家食品药品监督管理局药品评价中心专家。现任国家卫计委全国合理用药监测系统专家;国家食品药品监督管理局药品培训中心专家;中国非处方药协会专家。
药物基因组学(PGx)是以药物效应与安全性为目标,研究各种基因突变与药效及安全性的关系。因为基因编码的最终产物是蛋白质(表型), 因此,药物基因组学研究的对象是蛋白质而不是基因,即以涉及药物作用的药酶、转运体、受体、离子通道以及细胞内信息通路的各种传递分子等生物标记物(Biomarkers)为研究对象,也可以说,是研究基因的替代基因或候选基因(candidate gene)与药物效应及安全性之间的关系,从而为个体化用药奠定坚实地科学基础;PGx对药物影响的后果包括扩展药理作用;影响不良反应;改变药物毒性;增减药物剂量;减少前体活化;改变代谢途径以及加剧相互作用等。
β-阻滞剂—曾经是心血管疾病的基石药物,近年来在临床的地位逐渐受到质疑和挑战,尤其是刚刚公布的JNC-8中,已不再推荐β-阻滞剂用于高血压患者的初始治疗药物(中等推荐,证据水平B級);早在2006年英国NICE指南一样, β-阻滞剂被降为第四线用药!但2010年中国高血压防治指南;2013年欧洲高血压防治指南;以及2013年我国专家共识仍建议优选β-阻滞剂用于交感神经活性增强及心律徧快的心血管疾病患者! 为了既积极又安全用好β-阻滞剂,本课题主要介绍基因多态性对主经2D6代谢的美托洛尔和非经2D6代谢的比索洛尔的影响,以达到个体化用药之目的。
循环肿瘤DNA测序--陈巍学基因(26)
针对循环肿瘤DNA(ctDNA)的靶向捕获、深度测序,未来会是一个很有前景的临床肿瘤基因检测方案。
本视频介绍了其原理、技术难点、实验方法、数据分析特点,和分析结果的灵敏度、特异性。
Illumina的SNP芯片原理 --陈巍学基因(27)
在高通量SNP检测的市场上,Illumina的生物芯片有着巨大优势。新近很火的美国“23 and ME公司”,就是用的Illumina的Human Omni Express生物芯片来做SNP检测的。
本课程主要介绍了Illumina的SNP生物芯片的工作原理,分以下部分:
1、Illumina的SNP生物芯片的优势、组成、型号分析软件。
2、玻璃基片和微珠的特点和优势。
3、Address序列和 Probe序列的功能与设计。
4、SNP位点的区分方案。
Affymetix芯片原理--陈巍学基因(28)
陈巍学基因这个节目,主要是为大家介绍基因组学,和临床分子诊断的最新技术进展.
今天,主要和大家谈一下著名的生物芯片公司 Affymetrix 公司,以及它应用得最广的两种芯片:表达谱芯片、和SNP分型芯片。主要分为以下几个部分:
1.Affymetrix 芯片的制造过程,类似半导体芯片的制造过程,是通过光蚀刻来完成的。
2.Affymetrix 的表达谱芯片,分成传统的In Vitro Transcription 芯片和Whole Transcriptome 芯片。
3.Affymetrix 公司的基因分型芯片,也就是SNP分型芯片有两种实验原理:新的是Axiom芯片,是基于连接反应的;而老的卡式芯片,是基于目标DNA片段与探针序列进行杂交。
4.Affymetrix 分析表达谱的软件。