rnAscope原位杂交技术对复杂组织进行空间表达分析
rnAscope和BaseScope原位杂交(ISH)广泛应用于人类样本库和临床科研以及临床前动物模型等组织中的高分辨率目标rnA表达分析。ACD的rnA-ISH检测在临床实验研究中是有效的,能够在复杂的组织微环境中进行定量的、细胞特异性的表达分析。 rnAscope和相关ISH技术的应用进展包括: - 固定组织中rnA的单分子检测 - 空间、多重rnA-ISH用于rnAseq转录组学的验证 - SARS-CoV-2及其他病毒病原体检测 - 实体瘤组织中CAR-T细胞的检测 - AAV基因治疗的生物分布
专题讨论【SARS-CoV-2复制和rnA聚合酶抑制】
新冠肺炎疫情发生以来,武汉大学充分发挥自己突出的临床优势、突出的病毒学科优势等,为打赢疫情防控阻击战贡献智慧和力量。武汉大学病毒学系和医学病毒学研究所历史悠久、综合实力强,与中科院武汉病毒所联合建立病毒学国家重点实验室,为全国乃至全世界病毒学和疾病防控事业培养大量专业人才。同时,组织科研攻关,为打赢疫情防控阻击战提供强大科技支撑。 为了更广泛地分享武汉大学专家和校友在新冠病毒研究和疫情战斗中成果和经验,以科学的态度传播科学知识,帮助理解新冠肺炎治疗策略,并以此推动全球有关新冠病毒和疾病的研究,为最终战胜此次疫情和对未来新型新发传染病的防治作出贡献。武汉大学特邀请国内外相关领域杰出校友和专家举办“武汉大学新冠病毒和疾病系列学术讲座”。
安捷伦基因组学系列讲座 —— 安捷伦rnA和DNA平行测序文库构建方案,一天当作两天用
利用DNA和rnA的平行靶向测序可以比对序列差异、验证基因融合,检测DNA突变的关联基因表达水平变化。利用SureSelect XT HS2 rnA建库试剂盒,结合之前推出的 XT HS2 DNA试剂盒就可以轻松实现DNA和rnA的平行建库,实现上述应用。 之前我们已经介绍过XT HS2 DNA建库方案,本期将要介绍的SureSelect XT HS2 rnA 试剂盒是安捷伦最新推出的一款链特异性,靶向富集的rnA文库构建试剂盒。该试剂盒针对低起始量的FFPE样品进行了优化,样品起始量可低至10ng;试剂盒提供384对双端样本标签,接头序列中引入了分子标签,极大降低了测序中标签跳跃问题, 在去除Duplication时更准确;该试剂盒对整体建库流程进行了优化,建库时间缩短至11个小时。SureSelect XT HS2 rnA与SureSelect XT HS2 DNA采用同一建库流程,两款试剂盒的配套使用可以实现DNA和rnA的平行建库。
纳米孔长读长直接rnA测序与应用介绍
rnA测序(传统测序技术称为rnA-Seq)已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。它是研究发育生物学、人类遗传学和疾病相关病理学的宝贵工具。 基于短读长测序的rnA分析均需将rnA转化为互补DNA(cDNA)链,在这一过程中,逆转录或扩增可引入偏倚,且并非所有的转录物都以相同的效率扩增,这就会导致一些种类的rnA的中断以及其它种类rnA的过度扩增,同时在PCR扩增过程中会丢失有关碱基修饰的所有信息。 长读长纳米孔 rnA 测序能够以完整的全长序列对天然 rnA 或 cDNA 进行准确定量和鉴定,无需片段化或扩增,简化分析,并消除了潜在的偏好性来源。直接 rnA 测序还可以同步识别碱基修饰和核苷酸序列,目前纳米孔直接rnA测序能够处理的最长转录本目前长度超过20kb。 来自中国和世界各地的科学家已经将纳米孔rnA测序提供的众多独有优势运用到了各个不同领域,我们邀请到多个领域的研究者们在近期为大家带来纳米孔转录组测序系列研究讲座,分享他们利用纳米孔测序进行rnA研究的经验与成果。 首期,6月3日,我们邀请到福建农林大学林学中心席飞虎,武汉贝纳科技有限公司 副总经理陈虎,在线上带来他们利用纳米孔长读长测序平台进行直接rnA测序研究的实战经验和研究成果。
中国科学技术大学单革教授在线讲解“环rnA种类和功能”
近年来,随着基因组学和生物信息学的发展,尤其是高通量测序技术的大量应用,越来越多的非编码rnA 的调控机制被揭示,其中常见的具调控作用的非编码rnA包括小干涉rnA、mirnA、cirrnA以及长链非编码rnA。mirnA也广泛参与细胞的分化,增殖,凋亡,个体生长发育以及器官形成等生物学过程。mirnAs和lncrnAs还直接调控DNA损伤反应过程的细胞进展,mirnAs参与了细胞对DNA损伤的几乎所有方面,包括DNA损伤感知,损伤信号转到,受损DNA修复,激活细胞周期检查点和诱导细胞凋亡。 非编码rnA,尤其是micrornA参与了炎症反应的发展,它们对稳定和维持一些细胞类型的基因表型特征十分重要。本次线上直播将围绕非编码rnA调控机理, 技术方法以及与疾病关系邀请行业内知名专家学者,分享最新非编码rnA研究成果与经验,推动学科发展,促进转化医学及合作。