贾立军:Neddylation蛋白修饰-CRL 泛素连接酶通路调控肿瘤细胞自噬应答的机制与潜在应用
贾立军博士,复旦大学附属肿瘤医院肿瘤研究所研究员和博士生导师。目前主要从事“针对蛋白质翻译后修饰通路进行抗肿瘤分子靶点发现”等研究工作。
相关研究在 J Natl Cancer Inst(JNCI)、Cancer Research、Clinical Cancer Research、Autophagy、Cell Death & Differentiation、Cell Death & Disease、Int J Cancer和J Biol Chem等学术期刊发表文章40篇、获邀参编英文专著4部。主持国家自然科学基金(81372196,31071204,30500637,81172092)、国家重大科学研究计划(2012CB910302,课题负责)、上海市卫生局A类重点项目 (2010012)、上海市“浦江人才 ”资助计划(12PJ1400600)和上海高校特聘教授(东方学者)资助计划等科研项目。
学术兼职包括:国家自然科学基金委员会医学科学领域学科评审组专家、中华医学科技奖评审委员会委员、上海市免疫学会肿瘤免疫专业委员会委员、高等学校自然科学奖和技术发明奖评审专家和十余种学术期刊审稿专家。荣获上海高校特聘教授(东方学者)和上海市浦江人才等荣誉称号。
GCBI 生物云平台--陈巍学基因(24)
其明公司开发的 GCBI 生物云平台,可以让生物学家方便地、自助式地进行生物信息学分析,无需特别的软件、编程专业知识。
本视频介绍了这个平台,并演示了在这个平台上,以搭积木地方式,方便地、自助式地进行分析的过程。
秦正红:DRAM1 regulates autophagy flux and Bid-mediated cell death via lysosomes
秦正红,博士,教授,神经药理专业博士生导师。1994年在美国宾州医学院研究生院获博士学位,先后在美国国家卫生研究院(NIH)及麻省总医院和哈佛大学医学院从事研究工作。2003年从哈佛大学引进,现为苏州大学医学部基础医学与生物科学学院科研中心实验室主任,中国药理学会生化药理学专业委员会委员,中国药理学会神经药理学专业委员会委员,美国神经科学学会会员。
Damage-regulated autophagy modulator1 (DRAM1), a novel TP53 target gene, is an evolutionarily conserved lysosomal protein and plays an essential role in TP53-dependent autophagy activation and apoptosis (Crighton et al, 2006). However, the mechanisms by which DRAM1 promotes autophagy and apoptosis are not clear.
3-Nitropropionic acid (3-NP) is an inhibitor of mitochondrial respiratory complex II. Intrastriatal administration of 3-NP produces neuropathology resemble to Huntington disease. 3-NP-induced neuronal death was involved in autophagy and apoptosis. In vitro studies with 3-NP in TP53 wt and null cells, 3-NP or CCCP increased the protein levels of DRAM1 in a TP53-dependent or independent manner. DRAM1 induction contributed to 3-NP-induced autophagy activation. Knock-down of DRAM1 with siRNA inhibited the activity of V-ATPase, acidification of lysosomes and activation of lysosomal proteases. Knock-down of DRAM1 reduced the clearance of autophagososmes.
3-NP also induced a transcription independent upregulation of BAX protein levels. Knock-down of DRAM1 suppressed the increase in BAX levels. Co-immunoprecipitation and pull-down studies revealed an interaction of DRAM1 and BAX protein. Stably expression of exogenous DRAM1 increased the half-life of BAX. Upregulation of DRAM1 recruited BAX to lysosomes and induced cathepsin B-dependent cleavage of Bid and cytochrome c release. Knockdown of DRAM1, BAX or inhibition of lysosomal enzymes reduced 3-NP-induced cytochrome c release and cell death.
These data suggest that DRAM1 plays important roles in regulating autophagy flux and apoptosis. DRAM1 promotes autophagy flux through a mechanism involves activation of V-ATPase and enhances the acidification of lysosomes. DRAM1 promotes apoptosis via a mechanism involving recruitment of BAX to lysosomes to trigger cathepsin B-mediated Bid cleavage.
第一代DNA测序--陈巍学基因(25)
第一代DNA测序,是最经典的DNA测序方法。
本视频以BigDye试剂为主线,介绍了一代测序的三个最主要的技术:
Sanger先生发明的双脱氧(ddNTP)测序原理
BigDye的荧光标记方法
ABI 3500毛细管电泳分析原理
循环肿瘤DNA测序--陈巍学基因(26)
针对循环肿瘤DNA(ctDNA)的靶向捕获、深度测序,未来会是一个很有前景的临床肿瘤基因检测方案。
本视频介绍了其原理、技术难点、实验方法、数据分析特点,和分析结果的灵敏度、特异性。
KrosFlo 中空纤维过滤组件 - 卓越性能,优化澄清、浓缩及纯化工艺
改性聚醚砜(mPES)是一种新型亲水性膜过滤材料,可提供更高的过滤通量,从而缩短过滤时间。与其它膜材质相比,它具有更出色的分离选择性以及更低的蛋白结合率,产品收率更高。mPES中空纤维膜的无缝结构增强了膜的抗张强度,工艺寿命更长。
仕必纯新型改性聚醚砜中空纤维过滤器具有改性聚醚砜的所有性能优势。切向流过滤(TFF)的关键是料液在中空纤维膜表面的循环流动对膜表面带来的清洗效果。使用mPES中空纤维过滤器进行切向流过滤,相比膜包或死端过滤器等,优势明显。温和的错流进样可减缓过滤时膜孔堵塞,并可维持较高的过滤通量,保证产品收率。
在细胞治疗领域,切向流过滤可用于慢病毒载体的高倍浓缩以及治疗性细胞的漂洗以及浓缩、换液。
KR2i - 切向流过滤 - 慢病毒高倍浓缩理想选择
使用KrosFlo 研发用IIi 切向流过滤系统配用不同规格的KrosFlo 改性聚醚砜中空纤维过滤组件,可进行慢病毒载体的超高效浓缩,最高浓缩倍数可达5000倍,且可最大限度维持病毒活性。
此外,系统可对工艺参数进行实时监测和分析,保证工艺的可溯性和可重复性,且系统可配用可抛弃型流路,简化操作,避免交叉污染,方便验证。
Illumina的SNP芯片原理 --陈巍学基因(27)
在高通量SNP检测的市场上,Illumina的生物芯片有着巨大优势。新近很火的美国“23 and ME公司”,就是用的Illumina的Human Omni Express生物芯片来做SNP检测的。
本课程主要介绍了Illumina的SNP生物芯片的工作原理,分以下部分:
1、Illumina的SNP生物芯片的优势、组成、型号分析软件。
2、玻璃基片和微珠的特点和优势。
3、Address序列和 Probe序列的功能与设计。
4、SNP位点的区分方案。
Affymetix芯片原理--陈巍学基因(28)
陈巍学基因这个节目,主要是为大家介绍基因组学,和临床分子诊断的最新技术进展.
今天,主要和大家谈一下著名的生物芯片公司 Affymetrix 公司,以及它应用得最广的两种芯片:表达谱芯片、和SNP分型芯片。主要分为以下几个部分:
1.Affymetrix 芯片的制造过程,类似半导体芯片的制造过程,是通过光蚀刻来完成的。
2.Affymetrix 的表达谱芯片,分成传统的In Vitro Transcription 芯片和Whole Transcriptome 芯片。
3.Affymetrix 公司的基因分型芯片,也就是SNP分型芯片有两种实验原理:新的是Axiom芯片,是基于连接反应的;而老的卡式芯片,是基于目标DNA片段与探针序列进行杂交。
4.Affymetrix 分析表达谱的软件。
银屑病的新突破:以IL-17 通路为靶点
银屑病是一种慢性炎症性皮肤病,由免疫系统引发,其发病人数约占总人口的2-3%。最近,对免疫过程的研究取得了新的进展,带来了一些令人激动的新药物靶点。本视频主要介绍了IL-17如何被开发成治疗银屑病的新疗法。