Cell:山东大学校友一作!破解疱疹病毒复制“核心引擎”,揭开抑制剂作用机制
来源:iNature 2026-01-04 09:47
该研究报告了与HPIs结合的单纯疱疹病毒1 H/P复合物的冷冻电镜结构,显示这些将H/P复合物锁定在非活性状态。这些发现为理解疱疹病毒复制体组装和推进抑制剂开发提供了一个结构框架。
疱疹病毒是一种广泛存在的双链DNA病毒,具有终生潜伏期,可引起多种疾病。尽管靶向DNA聚合酶的抗病毒药物是有效的,但不断增加的耐药性强调了寻找替代药物的必要性。解旋酶-引物酶抑制剂(HPIs)是一种很有前途的抗病毒药物,但其作用机制尚不明确。此外,解旋酶-引物酶(H/P)复合体和DNA聚合酶如何协调疱疹病毒的基因组复制尚不清楚。
2025年12月29日,哈佛医学院Jonathan Abraham团队(论文第一作者于子朔博士,本科毕业于山东大学,博士毕业于复旦大学,目前在哈佛大学医学院 Jonathan Abraham 教授实验室进行博士后研究)在Cell 在线发表题为Mechanisms of HSV-1 helicase-primase inhibition and replication fork complex assembly的研究论文,该研究报告了与HPIs结合的单纯疱疹病毒1 H/P复合物的冷冻电镜结构,显示这些将H/P复合物锁定在非活性状态。
单分子分析显示HPIs导致H/P复合物在DNA上的解绕活性暂停。HPIs结合的复制叉复合体的结构,包括H/P复合体(UL5, UL52和UL8)和聚合酶全酶(UL30和UL42),揭示了一个以前未被表征的连接这些复合体的界面。这些发现为理解疱疹病毒复制体组装和推进抑制剂开发提供了一个结构框架。

疱疹病毒是一大群包膜双链DNA (dsDNA)病毒,含有许多高度流行的人类病原体。人类疱疹病毒有三个亚家族——α、β和γ。单纯疱疹病毒(HSV)属于α-疱疹病毒亚家族,许多成员在感觉神经元中建立终身潜伏期。有两种HSV血清型:HSV-1主要与口唇感染有关,HSV-2主要与生殖器溃疡有关。
HSV可在免疫正常的个体中引起脑膜脑炎,在免疫功能低下的个体中引起严重的播散性疾病。β-疱疹病毒亚家族包括人巨细胞病毒(HCMV),它可以在免疫功能低下的个体中引起先天性缺陷和严重疾病。γ-疱疹病毒亚家族包括Epstein-Barr病毒(EBV)和卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV),它们具有致癌性,分别引起淋巴瘤、鼻咽癌和卡波西肉瘤。
五种HSV蛋白在DNA复制叉处形成核心复制机制的酶。这些是异三聚体解旋酶-引物酶(H/P),包括UL5(解旋酶)、UL52(引物酶)和UL8(辅助蛋白),以及异二聚体聚合酶全酶,包括一个催化亚基(UL30)和一个加工因子(UL42)。HSV H/P复合物具有5′~ 3′解旋酶、ATP酶、引物酶和DNA结合活性。UL5属于超家族1解旋酶(SF1),它是一组多样化的单体和二聚体解旋酶。UL52是古真核引物酶(AEP)超家族的成员,是催化核心(AEP样结构域)。
在招募到病毒复制叉后,UL5解开dsDNA,而UL52在滞后链上合成短RNA引物,为DNA合成提供底物。UL8是H/P复合物核定位所需的辅助蛋白,并有助于解绕dsDNA。基于生物信息学分析,UL8被预测类似于催化死亡的B族DNA聚合酶,具有手掌,拇指和手指结构域。第六种蛋白质,单链DNA (ssDNA)结合蛋白感染细胞蛋白8 (ICP8, UL29),是复制机制的重要组成部分。
HSV聚合酶是一种具有3′-5′校对活性的B家族DNA聚合酶UL30包含拇指,手掌,手指,3′ -5′外切酶结构域和N端结构域(NTD)。NTD包含一个疱疹病毒特有的前NH2末端结构域(preN),它对病毒DNA合成很重要,但其功能尚不清楚。加工因子UL42增强DNA聚合酶对病毒DNA的亲和力,促进长链DNA的合成。UL42与真核增殖细胞核抗原(PCNA)具有相同的折叠,在DNA周围形成环状。然而,UL42作为单体发挥作用,不环绕DNA。

文章模式图(图源自Cell )
在疱疹病毒中,FDA批准的抗病毒药物仅适用于HSV、水痘带状疱疹病毒(VZV,另一种α-疱疹病毒)和HCMV(一种β-疱疹病毒)。目前大多数针对HSV的药物靶向病毒DNA聚合酶。阿昔洛韦及其口服前药valacyclovir是核苷类似物,需要被病毒胸苷激酶激活,几十年来一直用于治疗HSV感染。然而,这些药物在防止病毒再激活方面只是部分有效。焦磷酸盐类似物Foscarnet是一种二线药物,具有明显的副作用。耐药HSV毒株的出现,特别是在免疫抑制个体中,使得确定替代抗病毒策略成为当务之急。
HSV H/P复合物是一个有希望的靶点,可以满足对疱疹病毒额外抗病毒药物的需求。正在研究用于治疗HSV的H/P抑制剂(HPIs)是pritelivir 和pritelivir 衍生药物IM-250,它们分别处于3期和1期临床试验中。Amenamevir是一种HPI,在日本被批准用于临床治疗HSV和VZV。HPIs如何干扰H/P活性尚不清楚。此外,目前的人乳头瘤病毒抗体具有有限的抗病毒活性谱,并且缺乏对其结合位点和作用机制的了解,阻碍了其他疱疹病毒的人乳头瘤病毒抗体的发展。
该研究使用单粒子冷冻电子显微镜(cryo-EM)获得DNA和HPIs结合的HSV-1 H/P复合物的结构。这些结构与单分子实验相结合,揭示了HPIs将H/P复合物锁定在非活性状态,导致其在DNA上的解绕活性暂停。组装的复制叉复合体的结构也揭示了广泛的H/P聚合酶界面,包括在疱疹病毒中保守的特征。
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(25)01376-5
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