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Cell:为全球婴儿绘制“肠道菌”地图,邵岩/王舒意等研究终结“万能益生菌”神话,呼吁按地域“量体裁衣”

  1. 长双歧杆菌
  2. 婴儿双歧杆菌
  3. 婴儿益生菌产品

来源:iNature 2026-02-26 09:42

该研究完善了 BIL 物种分类学和菌株群体结构,绘制与年龄和地理特征相关的流行病学图谱,描述适应母乳和当地补充饮食的代谢适应性,并确定具有特定地理特征的 BI 菌株。

长双歧杆菌和婴儿双歧杆菌是新生儿肠道的早期定居菌,常被用作益生菌以促进婴儿的生长、发育和增强抗病能力。然而,主要源自高收入国家(HICs)的商业菌株可能并不适合低收入和中等收入国家(LMICs)的婴儿。

2026年2月18日,英国维康桑格研究所 Trevor Lawley团队(邵岩及王舒意为共同第一作者)在Cell 在线发表题为Genomic atlas of Bifidobacterium infantis and B. longum informs infant probiotic design的研究论文,该研究整合了来自 48 个国家的超过 4000 个基因组的全球基因组图谱,将来自低收入国家的代表性增加了 12 至 17 倍。

高分辨率的系统发育和功能分析支持将长双歧杆菌和婴儿双歧杆菌界定为具有不同功能和流行病学模式的独立物种。婴儿双歧杆菌在低收入国家的早期生命微生物群中占主导地位,但在高收入国家中很少被检测到。

天然的婴儿双歧杆菌菌株表现出极端的地理分层,并预测适应了当地富含植物糖的饮食和母乳衍生的底物,包括尿素和 B 族维生素。这个基因资源使基于基因的地理匹配菌株选择成为可能,以为不同婴儿群体提供更有效的益生菌和精准的微生物组疗法的信息。

人体内的微生物群落从出生时起便开始形成,这一过程受到母体和环境因素的影响。然而,抗生素、剖宫产、感染以及营养不良等都可能破坏这一过程,从而对儿童的生长发育和免疫相关疾病产生长期影响。因此,一个关键目标是通过新一代益生菌和活体生物治疗产品(LBPs)来促进健康的微生物群落发育,从而保障婴儿的健康。

长双歧杆菌长亚种(Bifidobacterium longum subsp. longum,BL)和长双歧杆菌婴儿亚种(B. longum subsp. infantis,BI)是婴儿肠道中占主导地位的早期菌群,它们在碳水化合物代谢和免疫刺激方面发挥着重要作用,因此是婴儿益生菌的理想选择,尤其适用于高风险人群。

然而,在大多数分类系统中,BI 仍被归类为 BL 的一个亚种,并且广泛使用的宏基因组数据库和流程将 BI 和 BL 合并为一个名为“婴儿双歧杆菌-长双歧杆菌复合体(B. infantis-longum complex)”(BIL)的单一类别,这掩盖了临床和人群研究中物种层面的模式。

文章模式图(图源自Cell )

关于 BIL 的现有基因组学知识也存在严重偏差:大多数参考基因组和益生菌菌株都源自少数来自高收入国家(HIC)的历史性分离株,而在低收入和中等收入国家(LMIC)中自然循环的菌株代表性不足。

在孟加拉国和菲律宾最近进行的试验表明,源自美国或欧洲捐赠者的商业 BI 菌株与当地菌株相比附着能力较差,这引发了担忧,即目前的产品可能并不适合许多目标人群。与此同时,美国食品药品监督管理局最近的警告强调,在早产婴儿因 BI 产品导致致命败血症病例发生后,有必要对婴儿益生菌进行仔细的基因组和表型评估。

该研究整合了来自 48 个国家的 4098 个 BIL 基因组的全球基因组图谱,使来自低中等收入国家的代表性增加了 12 至 17 倍。研究人员利用这一资源来完善 BIL 物种分类学和菌株群体结构,绘制与年龄和地理特征相关的流行病学图谱,描述适应母乳和当地补充饮食的代谢适应性,并确定具有特定地理特征的 BI 菌株,以指导设计更安全、更有效且针对不同地区的婴儿益生菌产品。

参考消息:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(26)00054-1

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