Nat Communi：浙江大学宋章法/王宇浩/蒋杭进/陈欢等合作揭示结直肠癌组织驻留微生物群的跨疾病阶段图谱及其诊断分组特异性特征

结直肠癌是全球发病率第三、死亡率第二的常见恶性肿瘤。肠道微生物与结直肠癌发生发展的关系已成为研究热点，但以往研究多集中于粪便微生物，而对直接定居于肠壁组织内部的“组织驻留微生物群”（tissue-resident microbiota, TRM）的分布规律及其在结直肠癌不同阶段的动态变化，仍缺乏系统性的图谱描绘。

2026年2月24日，浙江大学医学院附属邵逸夫医院宋章法、浙江大学转化医学研究院王宇浩、浙江大学数据科学研究中心蒋杭进、杭州微数生物科技有限公司陈欢作为共同通讯作者，在Nature Communications在线发表题为The landscape of tissue-resident microbiota across normal, polyp, and colorectal cancer tissues的研究论文。

该研究通过对1,134例临床组织标本（涵盖正常黏膜、癌前息肉及结直肠癌组织）进行高灵敏16S rRNA测序与严格污染控制，首次系统绘制了结直肠组织驻留微生物群的跨疾病阶段图谱，并揭示其在不同诊断分组间呈现高度特异性，而与传统临床分期及患者预后无明显关联。

研究团队采用生物素标记引物预扩增联合链霉亲和素磁珠富集技术，显著提升了组织中细菌DNA的检出效率，并结合定量PCR及机器学习算法，对TRM进行了深度解析。结果显示：正常、息肉、癌组织三者具有显著差异的微生物群落结构，且这种差异主要与组织学诊断类别挂钩，而非肿瘤TNM分期、分化程度、微卫星稳定性或患者生存期。 

基于随机森林算法，研究者从数百个菌属中筛选出由 假单胞菌属（Pseudomonas）、色素杆菌属（Pigmentiphaga）、梭杆菌属（Fusobacterium） 等组成的极小特征集，即可高精度区分正常、息肉与早期癌组织（AUC>0.9），并在独立外部队列及荧光原位杂交实验中得到验证。

值得注意的是，研究首次发现假单胞菌属在正常组织中丰度最高，随息肉、癌变逐渐降低；而梭杆菌属则呈相反趋势，从正常到息肉再到癌组织依次递增；色素杆菌属则在息肉组织中呈现“谷底”样分布。 这一连续变化模式提示特定TRM菌群可能参与结直肠癌的早期发生过程。

然而，当将分析限定在已确诊的结直肠癌患者内部时，TRM组成在各临床亚组之间未见显著分群，且无法有效预测患者5年生存结局（多因素Cox回归HR≈1.0）。

总体而言，该研究首次明确了TRM的组成变化主要对应“正常—息肉—癌”的组织学跃迁，而非癌后疾病进展。 这一发现为理解结直肠癌发生过程中的微生物生态演变提供了关键基础图谱，并提示基于组织标本的TRM特征分析有望成为现有病理评估之外的辅助风险分层工具。

尽管目前尚无法通过非侵入性手段直接检测TRM，但该研究揭示的核心菌群及其变化趋势为后续开发粪便、血液等液体活检标志物提供了重要靶点，也为探索特定菌群调控宿主肠道癌变的分子机制开辟了新方向。

本研究得到了国家自然科学基金、浙江省科技厅“尖兵领雁”研发攻关计划、浙江省医药卫生重大科技计划等项目的资助。

原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-69705-5