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Nature:血液中的微生物DNA可以预测癌症

来源:本站原创 2020-03-12 10:55

2020年3月12日讯 /生物谷BIOON /——癌症微生物组的系统表征为开发利用非人类、微生物衍生的分子来诊断人类重大疾病的技术提供了机会。而最近的一些研究表明微生物在一些癌症中扮演着关键的作用。

为此,来自加州大学圣地亚哥分校的Rob Knight带领他的研究小组重新审视了癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中未治疗过的33种肿瘤样品(总计18116个)的全基因组和全转录组测序数据,以寻找其中微生物的线索,研究人员在大多数癌症患者的血液和组织样品中发现了独特的微生物信号。

图片来源:UC San Diego Health Sciences

尽管使用了非常严格的去污染分析,放弃了高达92.3%的总序列数据,但研究人员发现当应用于Ia-IIc期的癌症患者或者没有任何基因组改变(经两个商用级的无细胞肿瘤DNA平台检测确认)的癌症患者时,这些TCGA血液特征仍然具有预测性。

此外,研究人员还发现仅使用血浆来源的、无细胞的微生物核酸就可以区分来自健康的、无癌症的个体(n = 69)和来自多种癌症患者(前列腺癌、肺癌和黑色素瘤,n=100)的样本。

该研究作者Miller-Montgomery表示:"这种对微生物种群随癌症变化方式的新认识可能会开辟一条全新的治疗途径。我们现在知道微生物在那里,但它们在做什么呢?我们能否操纵或模仿这些微生物来治疗癌症?"

研究人员表示这一潜在的基于微生物的肿瘤诊断工具值得进一步探索。(生物谷Bioon.com)

参考资料:

Rob Knight et al. Microbiome analyses of blood and tissues suggest cancer diagnostic approach. Nature. 2020. DOI https://doi.org/10.1038/s41586-020-2095-1
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