Nat Immunol：揭示CCR5AS lncRNA多态性影响HIV感染
来源：本站原创 2019-07-25 11:05
2019年7月25日讯/生物谷BIOON/---人类免疫缺陷病毒（HIV），即艾滋病病毒，是导致获得性免疫缺陷综合征（AIDS，俗称艾滋病）的病毒。HIV感染仍然是主要的公共卫生负担。仅在美国就有一百多万人感染HIV，而且每年报道的新病例超过5万例。在一项新的研究中，美国德州生物医学研究所助理教授Smita Kulkarni博士和美国弗雷德里克国家癌症研究实验室的Mary Carrington博士
2019年7月25日讯/生物谷BIOON/---人类免疫缺陷病毒（HIV），即艾滋病病毒，是导致获得性免疫缺陷综合征（AIDS，俗称艾滋病）的病毒。HIV感染仍然是主要的公共卫生负担。仅在美国就有一百多万人感染HIV，而且每年报道的新病例超过5万例。
在一项新的研究中，美国德州生物医学研究所助理教授Smita Kulkarni博士和美国弗雷德里克国家癌症研究实验室的Mary Carrington博士领导的一个研究团队确定了一种长链非编码RNA（lncRNA）影响一种参与HIV感染和疾病进展的关键受体。这种新鉴定出的机制可能为控制HIV感染开辟了一条新的途径。相关研究结果发表在2019年7月的Nature Immunology期刊上，论文标题为“CCR5AS lncRNA variation differentially regulates CCR5, influencing HIV disease outcome”。
基因组的大部分由非编码RNA组成，这些非编码RNA不能直接翻译为蛋白。事实上，97％的人类基因组不能编码蛋白。Kulkarni说，直到最近十年左右，科学家们才知道这些特殊RNA中的多数并非“垃圾”。如今，这项新的研究表明它们发挥着很多作用。近期在技术和基因组学方面的突破使得这一领域取得了新进展。
Kulkarni和她的同事们发现一种称为CCR5AS的特定lncRNA影响编码HIV辅助受体CCR5的基因。鉴于CCR5对于HIV病毒侵入细胞至关重要，因此与这种lncRNA的表达变化相关联的多态性会影响HIV感染的结果。来自西班牙裔美国人、非洲裔美国人和日本人等各种群体的基因组DNA表明这种关联性存在于许多种族中。这种关联性在不同人群中的一致性表明存在一种解释这种关联性的单个功能性机制。
Nature Immunology期刊还针对这项新研究发表了一篇标题为“A SNP of lncRNA gives HIV-1 a boost”的评论性文章，这进一步突出了这项研究在这个领域的重要性。在这篇评论性文章中，Sanath Kumar Janaka和David T. Evans写道，“这项研究为调控元件中的多态性如何解释发病机制中的遗传变异提供了新的见解。”他们接着称Kulkarni团队取得的这一发现是一种“迷人而复杂的机制”。
Kulkarni说道，“他们的评论令人鼓舞，促使我们进一步探索。”
Kulkarni解释道，“寻找疾病相关基因区域的功能机制将增加我们对它们如何调节疾病相关基因和途径的理解。我们或许能够找到用于开发新疗法的选择性靶点。”
Kulkarni说，这项新研究中取得的这些发现可能对其他传染病的进展有影响。她补充说:“我们可以用很多方法来使用从这项研究中学到的技术---这正是我们在我们的实验室中建立的。我们能够将它们应用到德州生物医学研究所和其他许多研究机构当前正在研究的许多其他的病原体上。”（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
Smita Kulkarni et al. CCR5AS lncRNA variation differentially regulates CCR5, influencing HIV disease outcome. Nature Immunology, 2019, doi:10.1038/s41590-019-0406-1.
Sanath Kumar Janaka et al. A SNP of lncRNA gives HIV-1 a boost. Nature Immunology, 2019, doi:10.1038/s41590-019-0422-1.
Scientists pinpoint new mechanism that impacts HIV infection
在一项新的研究中，美国德州生物医学研究所助理教授Smita Kulkarni博士和美国弗雷德里克国家癌症研究实验室的Mary Carrington博士领导的一个研究团队确定了一种长链非编码RNA（lncRNA）影响一种参与HIV感染和疾病进展的关键受体。这种新鉴定出的机制可能为控制HIV感染开辟了一条新的途径。相关研究结果发表在2019年7月的Nature Immunology期刊上，论文标题为“CCR5AS lncRNA variation differentially regulates CCR5, influencing HIV disease outcome”。
图片来自Nature Immunology, 2019, doi:10.1038/s41590-019-0406-1。
基因组的大部分由非编码RNA组成，这些非编码RNA不能直接翻译为蛋白。事实上，97％的人类基因组不能编码蛋白。Kulkarni说，直到最近十年左右，科学家们才知道这些特殊RNA中的多数并非“垃圾”。如今，这项新的研究表明它们发挥着很多作用。近期在技术和基因组学方面的突破使得这一领域取得了新进展。
Kulkarni和她的同事们发现一种称为CCR5AS的特定lncRNA影响编码HIV辅助受体CCR5的基因。鉴于CCR5对于HIV病毒侵入细胞至关重要，因此与这种lncRNA的表达变化相关联的多态性会影响HIV感染的结果。来自西班牙裔美国人、非洲裔美国人和日本人等各种群体的基因组DNA表明这种关联性存在于许多种族中。这种关联性在不同人群中的一致性表明存在一种解释这种关联性的单个功能性机制。
Nature Immunology期刊还针对这项新研究发表了一篇标题为“A SNP of lncRNA gives HIV-1 a boost”的评论性文章，这进一步突出了这项研究在这个领域的重要性。在这篇评论性文章中，Sanath Kumar Janaka和David T. Evans写道，“这项研究为调控元件中的多态性如何解释发病机制中的遗传变异提供了新的见解。”他们接着称Kulkarni团队取得的这一发现是一种“迷人而复杂的机制”。
Kulkarni说道，“他们的评论令人鼓舞，促使我们进一步探索。”
Kulkarni解释道，“寻找疾病相关基因区域的功能机制将增加我们对它们如何调节疾病相关基因和途径的理解。我们或许能够找到用于开发新疗法的选择性靶点。”
Kulkarni说，这项新研究中取得的这些发现可能对其他传染病的进展有影响。她补充说:“我们可以用很多方法来使用从这项研究中学到的技术---这正是我们在我们的实验室中建立的。我们能够将它们应用到德州生物医学研究所和其他许多研究机构当前正在研究的许多其他的病原体上。”（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
Smita Kulkarni et al. CCR5AS lncRNA variation differentially regulates CCR5, influencing HIV disease outcome. Nature Immunology, 2019, doi:10.1038/s41590-019-0406-1.
Sanath Kumar Janaka et al. A SNP of lncRNA gives HIV-1 a boost. Nature Immunology, 2019, doi:10.1038/s41590-019-0422-1.
Scientists pinpoint new mechanism that impacts HIV infection
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