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Genome Res: 科学家们创建了新的线虫标准品系

来源:本站原创 2019-05-24 21:26

2019年5月24日 讯 /生物谷BIOON/ --最近一项研究表明:大多数研究所依据的线虫的基因组存在缺陷。现在,他们提供了一个新的基因组序列,这将提高未来研究的准确性。

科学家在研究中使用的一种模式生物是一种叫做秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)的蠕虫。这也是第一个进行基因组测序的多细胞真核生物。线虫易于生长,生物结构简单,没有骨骼,心脏或循环系统。同时,它与人类共享许多基因和分子途径,使其成为研究基因功能,药物治疗,衰老和人类疾病(如癌症和糖尿病)的首选模型。

(图片来源:Marie-Anne Félix, Ecole Normale Supérieure)

秀丽隐杆线虫的遗传研究基于一种称为N2的品系,研究人员已经从明尼苏达大学的线虫库存中心订购了数十年。“在过去的十年中,随着使用高水平DNA测序的更先进的遗传实验,我们发现每个实验室所用的线虫品系基因组都不大相同”分子科助理研究教授Erich Schwarz说。 “40多年来,出现了许多不同的品系,因此我们不再能依赖它们中的任何一个进行实验。”
在最近发表在《Genome Research》杂志上的研究中,作者描述了一种名为VC2010的新品系。来自东京大学,斯坦福大学,不列颠哥伦比亚大学和明尼苏达大学的Schwarz及其同事利用尖端技术对VC2010的基因组进行测序并创建这一新的标准。

作为研究的一部分,研究人员将VC2010与原始N2基因组进行了比较。“除了我们预计会看到的1亿个核苷酸外,我们还发现了额外的2百万个不同的核苷酸,这占据了线虫基因组的2%,”这可能是由于旧技术的局限性所致。(生物谷Bioon.com)


资讯出处:Scientists create new standard genome for heavily studied worm

原始出处:Genome Research (2019). genome.cshlp.org/content/early … .244830.118.full.pdf

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