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Nat Commun:科学家发现慢性低度炎症的遗传位点

来源:生物谷原创 2022-04-30 10:34

慢性炎症是对刺激剂、损伤或失调性急性炎症的长期炎症反应。慢性低度炎症与许多复杂疾病有关,包括癌症、心血管疾病(CVD)、呼吸系统疾病,自身免疫性疾病和内分泌代谢疾病。

慢性炎症是对刺激剂、损伤或失调性急性炎症的长期炎症反应。慢性低度炎症与许多复杂疾病有关,包括癌症、心血管疾病(CVD)、呼吸系统疾病,自身免疫性疾病和内分泌代谢疾病。然而,将慢性低度炎症与慢性疾病联系起来的潜在分子途径知之甚少。C-反应蛋白(CRP),一种主要由肝脏产生的急性期蛋白,已被确定为全身炎症的标志物。环境和遗传因素对血清 CRP水平有重大影响。在前期的遗传关联研究中,已经确定了58个独特的位点,使用来自约200,000名欧洲人的数据,解释了约7%的CRP水平变异。尽管如此,这种复杂特征的遗传结构仍没有得到很好的表征。

近日,来自英国伦敦帝国理工学院的研究学者在Nat Commun上发表了一篇题为“Genetic analysis of over half a million people characterises C-reactive protein loci”的研究论文,解开了循环CRP水平的潜在遗传成分可以阐明CRP参与疾病过程的机制,发现了调节炎症的潜在治疗靶点。

在该研究中,研究人员报告了关于CRP水平的最大的全基因组关联研究(GWAS),使用的数据来自英国生物库(UKB)和基因组流行病学中的心脏和衰老研究队列(CHARGE)联盟。此外,他们进行了一系列GWAS后的分析,以阐明研究结果的功能特点,并突出潜在的潜在途径。最后,他们进行了全表型关联研究(PheWAS),从宏观上研究慢性炎症的临床后果,并辅以孟德尔随机化(MR)分析来评估因果关系。

通过对英国生物样本库参与者(N = 427,367,欧洲血统)和基因组流行病学(CHARGE)联盟(总N = 575,531欧洲血统)中关于全身炎症标志物C反应蛋白(CRP)的最大全基因组关联研究(GWAS),他们确定了266个独立位点,其中211个以前没有被报道过。基因集分析突出了42个与CRP水平相关的基因集(p ≤ 3.2×10−6)和组织表达分析表明CRP相关基因与肝脏和全血基因表达有很强的相关性。表型组范围关联研究确定了27项与遗传确定的CRP相关的临床结局,随后的孟德尔随机化分析结果支持与精神分裂症,慢性气道阻塞和前列腺癌的因果关系。

图 双样本孟德尔随机化结果

总之,该研究结果确定了慢性低度炎症的遗传位点和功能特性,并为与一系列疾病的因果关系提供了证据。

参考文献:Said, S., Pazoki, R., Karhunen, V. et al. Genetic analysis of over half a million people characterises C-reactive protein loci. Nat Commun 13, 2198 (2022). https://doi.org/10.1038/s41467-022-29650-5

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