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北京基因组所开发系列特色科学数据库

近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表,并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas、犬类数据库iDog、RNA编辑与疾病相关知识库EDK、植物RNA编辑数据库PED、人类长非编码RNA数

2018-11-11

Nature:发现最大白血病数据库 辅助治疗药物的最优选

 历经多年研究,科学家们发布了一个庞大的数据集,详细描述了500多名患有急性髓细胞性白血病(Acute myeloid leukemia,AML)患者肿瘤细胞的分子组成。该数据集包括数百个个体患者的细胞如何在实验室中对一系列药物做出反应,为日后对于AML的研究进一步打下基础。10月17日,《Nature》杂志以“Functional genomic landscape of acute

2018-10-19

PNAS:长链编码RNA或在大脑发育和信号传递过程中扮演关键角色

2018年10月14日 讯 /生物谷BIOON/ --日前,一项刊登在国际杂志Proceedings of the National Academy of Sciences上的研究报告中,来自斯克利普斯研究所的研究人员通过对发育中大脑细胞的细胞核进行深入研究发现,长链非编码RNAs或许在突触的健康功能及维护上扮演着重要的角色,突触是大脑神经细胞间的连接点。图片来源:Vossman/ Wikiped

2018-10-13

Nature:推出小鼠细胞的开源数据库---Tabula Muris

2018年10月5日/生物谷BIOON/---来自美国斯坦福大学、陈-扎克伯格生物中心(Chan Zuckerberg Biohub),弗吉尼亚州帕洛阿尔托医疗保健系统和加州大学的一个庞大的研究团队组建了一个名为Tabula Muris的小鼠细胞信息的开源数据库(网址:https://tabula-muris.ds.czbiohub.org/)。在他们发表在Nature期刊上的标题为“Single

2018-10-05

升级版环形RNA数据库网站发布

  近日,国际学术期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康院)中科院-德国马普计算生物学伙伴研究所杨力研究组关于环形RNA研究的最新进展“CIRCpedia v2: An Updated Database for Comprehensive Circular RNA Annotati

2018-09-20

Nature子刊:编码RNA癌症药物基因组图谱新突破

  近日,匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归(Elastic Net regression)的机器学习模型,从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱(long noncoding RNAs, lncRNAs)与265种抗癌药物敏感性数据中,挖掘出了27,341对lncRNA-药物可预关联(lncRNA-drug predictiv

2018-09-04

北林分子育种团队在新型编码RNA转录调控机制方面取得新进展

近日,国际植物学TOP期刊《Plant Biotechnology Journal》(IF: 7.443, 植物学一区)发表北京林业大学林木分子育种创新团队研究成果,题目是“Osmotic stress-responsive promoter upstream transcripts (PROMPTs) act as carriers of MYB transcription factors to

2018-08-26

长链编码RNA在沙棘果实花青素合成中的调控作用研究取得重要新进展

沙棘(拉丁学名:Hippophae rhamnoides Linn.)是一种落叶性灌木,其特性是耐旱、抗风沙,可以在盐碱化土地上生存,因此被广泛用于水土保持。中国西北部大量种植沙棘,用于沙漠绿化。沙棘果实中维生素C含量高,素有维生素C之王的美称。沙棘是植物和其果实的统称。植物沙棘为胡颓子科沙棘属,是一种落叶性灌木。国内分布于华北、西北、西南等地。沙棘为药食同源植物。沙棘的根、茎、叶、花、果,特别是

2018-08-26

编码RNA研究技术大盘点

非编码RNA可火了,miRNA大火烧了十几年,现在慢慢地把lncRNA的领域也给点着了。现在可能连实验室的插枪头阿姨都知道绝大多数的RNA分子并不翻译,这非编码RNA(noncoding RNA),包括miRNA、lncRNA等。目前主要研究方向集中在非编码RNA 及其相互结合的DNA、RNA、蛋白质等科学问题,而科学问题的解答依赖于实验技术的创新使用和革命。ncRNA可以海陆空全面调控细胞功能,

2018-08-06

2018国自然编码RNA项目必备热点

lncRNA、circRNA作为近年的研究热点,2017年在国家自然科学金获批的项目方面有了巨大的飞跃,2018年国自然基金申请在即,小编整合ncRNA领域高分文章研究思路及创新点,带您一起迅速get国自然基金申请必备热点~生物标记物筛选lnRNA及circRNA相较mRNA具有更高的组织与时空特异性,并可通过多种方式在转录及转录后水平发挥调控作用,是疾病早期诊断及预后生物标记物的最佳候选。Bio

2018-08-06