MIT最新研究：从氨基酸链片段直接预测蛋白质功能
就在几个月前，DeepMind推出了AlphaFold系统，这个被称为生物界“AlphaGo”的系统能够预测并生成蛋白质3D结构。而近日，来自MIT的研究人员开发了一个新的研究模型，能够直接预测氨基酸链片段是如何决定蛋白质功能的。这一发现可以帮助研究人员设计和测试新的蛋白质，从而用于药物研发和生物学研究。我们都知道，蛋白质是维持我们生命所必需的庞大而复杂的物质。蛋白质具体能完成什么样的
南京农大构建世界首个植物重复基因数据库
2月21日，南京农业大学园艺学院教授张绍铃团队在国际著名学术期刊Genome Biology在线发表研究论文，系统鉴定了梨等141种植物基因组中不同类型重复基因，构建世界首个植物重复基因数据库，揭示重复基因进化的普遍规律。植物在千百年的进化中，怎样变得越来越多姿多彩？一个重要因素就是植物会复制自己基因，丰富自己的基因库数量。团结起来力量大，多了自己的“同胞胎”兄弟姐妹，基因在生物体中就
Genetics：嵌套CRISPR利用长片段进行高效的基因组编辑
2019年2月14日讯/生物谷BIOON/---CRISPR是一种通过高精度基因组编辑引发生物医学研究变革的技术。然而，即使它允许相对容易地产生或校正由单个或几个核苷酸组成的突变，在对基因组中较大DNA片段进行编辑时，它仍然存在着限制。比如，将产生荧光蛋白（比如广泛使用的绿色荧光蛋白）的基因插入到基因组中具有较低的效率，而且涉及复杂的克隆步骤。在一项新的研究中，西班牙Bellvitge生物医学研究
因图片重复等问题，Nature期刊撤回一篇关于利用CAR-T细胞疗法治疗脑癌的论文
2019年2月23日讯/生物谷BIOON/---2018年9月，由美国贝勒医学院科学家领导的27名研究人员在Nature期刊上发表了一篇标题为“A homing system targets therapeutic T cells to brain cancer”的论文。这篇论文报道了一种允许免疫细胞胞越过血脑屏障并靶向难以触及的脑瘤的新技术。在出版后同行评审网站PubPeer上收到50多条匿名的
剑桥科学家发现循环肿瘤DNA片段大小特征，更灵敏地检测早期肿瘤或成现实
从2016年FDA批准首个基于EGFR基因突变的液体活检产品，到今年8月bTMB被证实可以预测免疫治疗的效果，液体活检已在肿瘤治疗领域大放异彩。不幸的是，血液中的肿瘤循环DNA分子含量通常远远低于血液中非癌症相关DNA的片段，这使得检测它们非常困难，特别是在癌症的早期阶段。今天，英国剑桥大学科学家Nitzan Rosenfeld带领的团队，终于为液体活检打开了封印。他们发现
Nature：对人胚胎进行CRISPR/Cas9基因编辑会导致大片段DNA缺失
2018年8月10日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自澳大利亚阿德莱德大学、南澳大利亚健康与医学研究所、拉筹伯大学、新加坡-麻省理工技术研究联盟和美国天普大学的研究人员发现了实现胚胎基因编辑潜在益处的一个重大障碍。相关研究结果发表在2018年8月9日的Nature期刊上，论文标题为“Large deletions induced by Cas9 cleavage”。论文通信作者为阿德
首次破解人cGAS的三维结构，揭示它为何识别长片段DNA同时忽略短片段DNA
2018年7月23日/生物谷BIOON/---人体是为生存而建造的。人体中的每一个细胞都受到一组免疫蛋白的严密保护，而且这些免疫蛋白装备了几乎万无一失的雷达来检测外来的或受损的DNA。人细胞中的一个最为关键的哨兵是一种被称作cGAS的“第一响应者”蛋白，它检测外来的和发生癌变的DNA的存在，并启动一种信号级联反应，从而触发身体防御。2012年蛋白cGAS的发现引发了科学探究的风暴，迄今为止，科学家
Nat Biotechnol：厄运不断，CRISPR/Cas9基因编辑竟导致大片段DNA缺失和重排
2018年7月18日/生物谷BIOON/---在几天前的一项研究中，来自美国伊利诺伊大学芝加哥分校的研究人员发现在利用CRISPR/Cas9进行基因编辑遭遇失败（大约在15％的时间发生）时，这通常是由于Cas9蛋白持续地结合到DNA上，这会阻止DNA修复酶进入切割位点（详情参见生物谷新闻报道：Mol Cell：揭示CRISPR/Cas9基因编辑为何有时会遭遇失败）。科学家们已将CRISPR基因编辑
FSI Genetics：新工具可从未知个体的DNA片段预测出该个体的眼睛、毛发和皮肤颜色！
2018年5月18日讯 /生物谷BIOON /—最近，一个由美国印第安纳大学科学院和荷兰鹿特丹Erasmus MC大学医学中心的科学家领导的国际团队开发出了一种新工具，该工具能从犯罪现场或考古遗迹等场景中获得的人类生物样本--即使是很小的DNA样本--中准确预测出样本所有者的眼睛、头发和皮肤的颜色。这种一体化的色素分析工具采用的是一种前所未有的方式，通过一个开放获取的网络工具将三种色素的特性集合在
Nat Commun：新技术使得神经学实验变得更加容易重复
2018年3月18日 讯 /生物谷BIOON/ --过去几年来，科学家们一直面临一个问题，那就是他们难以重复自己活着同行们之前的研究成果。这种"重复性困难"问题在很多领域都有体现，包括医学与物理学。而且造成这一问题的原因也是多种多样的。然而，其中一个原因是毫无疑问的，那就是实验中所做的大规模数据分析的结果难以共享。（图片来源：Www.pixabay.com）对此，来自华盛顿大学的研究者们开发出了一