Biomicrofluidics:利用时间序列数据高准确率地绘制基因组图谱
2016年1月5日讯/生物谷BIOON/如果你已经有了一种有机体的基因组序列图谱,但想在图谱中找到异常结构,那么你可以通过在一些靶点中切断DNA序列并检测切割点之间的距离来检查基因条码。然而,原始基因图谱在允许研究有
Nat Genet:看似无用的重复性DNA或发挥着巨大的作用
近日,一项刊登在国际著名杂志Nature Genetics上的研究论文中,来自纽约哥伦比亚工程和基因组中心的科学家们通过对基因表达的短串联重复序列(STRs)进行全基因组关联性分析发现,被认为无作用或者“垃圾”的STRs实际上在调节基因表达上扮演着重要的角色,相关揭开了调节基因表达的一类新型的遗传突变。
The ISME J:CRISPR序列帮助理解噬菌体-宿主相互作用的演变历史
近日,一项刊登在国际杂志The ISME Journal上的研究报告中,来自美国能源部联合基因组研究所的研究人员利用来自北加州铁山公司的宏基因组数据库和专门的工具,在CRISPRs的帮助下成功地在生态系统研究中将宿主和噬菌
Cell:中国科学家揭示CRISPR获取新间隔序列的分子机制
10月15日,Cell 杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所王艳丽研究组关于CRISPR-Cas系统中外源片段获取阶段的研究进展。
实验的可重复性差都有哪些原因?
在上个月末的《Science》杂志上,美国弗吉尼亚大学的Brian Nosek作为通讯作者,发表了题为《Estimating the reproducibility of psychological science》的研究文章。文中,研究者们提到,尽管他们能够重复出最近的1
科学狂人C.Venter:5年后全球将拥有500万个人基因组序列
2000年,科学家们完成了第一个人类基因组草图。虽然从草图完成之日起,测序成本就迅速降低,导致大量的基因组数据产生,但是到今天,我们并没有将基因组信息充分利用起来。
:世界首次公开和破译双峰驼全基因组序列图谱
11月13日,中国科学院上海生命科学研究院/中国科学院系统生物学重点实验室李亦学研究员课题组与内蒙古农业大学、上海交通大学、南开大学等研究机构的科研人员合作完成了世界首例双峰驼全基因组序列图谱绘制和破译工作,成果在Nature子刊Nature Communications上在线发表,这项工作的生物信息学分析部分的主要研究骨干是系统生物学重点实验室的丁国徽副研究员,王振博士后以及李圣迪研究生等。
PLoS ONE:白介素-3基因序列变异影响人类大脑容量
神经系统是人类区别于其他物种最显著的特征之一。相对于其他物种,人类的大脑高度发达,主要体现在全脑容量的变化。如人类的大脑容量是旧大陆猴-如猕猴脑容量的20.6倍,长臂猿的14.4倍,与人类亲缘关系最近的灵长类-黑猩猩的4.3倍。
JCI:发现一小段DNA序列控制血细胞发育和血管完整性
2012年9月11日 讯 /生物谷BIOON/ --蛋白GATA2被称为血细胞发育的主要调节物。当编码GATA2的基因发生突变时,严重性血液疾病如急性髓系白血病(acute myeloid leukemia, AML)就会产生。 美国威斯康星大学麦迪逊分校研究人员和美国国家卫生研究院的合作者开展合作,重点研究GATA2基因,从而意外地发现一小段DNA序列促进这种强大的主要调节物表达。
Nat Methods:澳大利亚科学家发明“拼写检查”基因序列新方法
澳大利亚昆士兰大学的科学家发明一种快速,可靠,简便的纠错方法,可如同计算机检查文字拼写错误那样,发现基因测序过程中产生的扩增序列DNA代码错误。这项成果发表在今年5月出版的《自然》旗下子刊《自然方法学》Nature Methods上。 新方法编制的软件称为“刺槐(Acacia)”,特别适用于分析微生物基因的重要片段——扩增子。