Nature Methods：肿瘤进化的空间图谱，CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异，还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹，绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
Science：用AI模拟5亿年的进化，创造出全新荧光蛋白，重新点亮生物学
这项新研究所展示的 ESM3 模型，训练自地球上多达数十亿的天然蛋白质，ESM3 也是当今世界上训练于最高通量 GPU 集群之一的前沿生物学生成式人工智能模型。
2025-02-27
Nature：人类DNA的快速进化让我们拥有了最强大脑，但也带来了自闭症等脑部疾病
研究团队筛选出了 20 个人类 HAR 及其黑猩猩同源序列，利用单细胞 CRISPR 干扰（CRISPRi）技术进行功能表征，并验证了这些序列具有物种特异性的基因调控作用。
2025-03-07
模拟5亿年进化，从头创造出全新荧光蛋白，重新点亮生物学
ESM3 是一款向生命科学领域的前沿人工智能语言模型，也是第一个同时对蛋白质的序列、结构和功能进行推理的生成式人工智能模型，它提升了我们利用生命密码进行编程和创造的能力。
2025-03-28
生命起源的“惊人发现”Cell：新研究发现阿斯加德古菌除了具有肌动蛋白丝外，还具有微管
在一项新的研究中，Pilhofer团队发现了阿斯加德古菌具有微管，并描述了它们的结构。这些实验表明，阿斯加德古菌的微管蛋白形成非常相似的微管，尽管比它们的真核生物亲属中的微管小。
2025-04-04
Nature：张二荃团队证明调控昼夜节律的核心组分RUVBL2是真核生物钟的共同起源分子
该研究证实了 RUVBL2 作为核心生物钟组分的作用，还揭示了其 ATP 酶活性如何以类似于蓝藻中的 KaiC 的机制调节真核生物的昼夜节律。
2025-03-30
Science：恶性疟原虫体外系统进化揭示了这种疟原虫产生耐药性的关键决定因素
作者分析了在实验室中进化出的724种恶性疟原虫的基因组，这些恶性疟原虫对118种不同的抗疟疾化合物具有耐药性，其中既包括已有的药物，也包括新的实验药物。
2024-12-05
Acta Pharmaceutica Sinica B：藏红花基因组揭示了藏红花素生物合成的进化起源
本研究报道了鸢尾科药用植物C. sativus首个染色体水平基因组，为鸢尾科药用植物的基因组进化和物种形成提供了重要的见解。
2024-04-09
研究解析人植入前胚胎中DNA羟甲基化的起源、命运与功能
这些发现揭示了5hmC在人早期胚胎发育中的独特动态以及功能多面性，为理解人早期胚胎发育过程中的多能性建立、细胞谱系分化和转录-表观调控之间的关系奠定了基础。
2024-08-13