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研究开发单细胞空间转录组数据分析可视化平台

单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年Science 杂志评选的十大科学突破之首。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息,而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相

2019-11-16

研究人员揭示乳腺细胞发育中细胞状态特异性转录因子网络和细胞谱系关系

  2019年10月8日,美国圣地亚哥的Salk研究所的Geoffrey Wahl团队在Cell Reports杂志上发表文章“Single-Cell Chromatin Analysis of Mammary Gland Development Reveals Cell-State Transcriptional Regulators and Lineage Relation

2019-11-07

研究人员揭示RNA聚合酶在大肠杆菌细胞内的空间组织及其与转录的关系

  2019年9月16日,PNAS杂志在线发表了约翰霍普金斯大学医学院肖杰博士团队的研究成果,题为“Spatial organization of RNApolymerase and its relationship with transcription in Escherichia coli”。该工作揭示了RNA聚合酶(RNAP)簇的特征及其在细胞内空间分配模式不仅依赖于rR

2019-11-04

研究揭示RNA甲基化调控R-loop形成及转录终止机制

  R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构,在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等,但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高的修饰类型,广泛参与哺乳动物的发育、免疫、干细胞更新、脂肪分化以及肿瘤生成和转移

2019-10-16

Nat Biotechnol:利用I型CRISPR/Cas系统对人细胞进行靶向转录调节

2019年10月7日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,美国杜克大学生物医学工程副教授Charles Gersbach、Gersbach实验室博士后研究员Adrian Oliver及其团队首次描述了他们如何成功地利用I型CRISPR系统开启和关闭基因,并对人细胞中的表观基因组进行编辑。他们希望这能够极大地扩展生物医学工程师可用的基于CRISPR的工具,从而开启一个多样化的基因组工程技术新

2019-10-07

MSB:转录因子浓度的时间波动或会影响胚胎干细胞的分化命运

2019年10月6日 讯 /生物谷BIOON/ --蛋白质浓度的时间变化如何影响生物学?这是一个生物学家们最近才开始研究解决的问题,而且越来越多的研究结果表明,特定蛋白质数量的随机时间变化在生物学过程中起着直接而且重要的角色。近日,一项刊登在国际杂志Molecular Systems Biology上的研究报告中,来自瑞士洛桑联邦理工学院等机构的科学家们通过研究发现,蛋白质浓度的时间波动或能决定胚

2019-10-06

JBC:鉴别出维持胰岛β细胞功能的新型转录因子复合体成员

2019年9月20日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Journal of Biological Chemistry上的研究报告中,来自阿拉巴马大学伯明翰分校等机构的科学家们通过研究在转录因子复合物中发现了能够维持β细胞功能的新成员。胰岛中的β细胞能够产生胰岛素来调节机体血糖水平,同时还能为全身的细胞提供能量,而β细胞的缺失或功能异常常常会引发糖尿病,糖尿病是全球人群所面临的

2019-09-20

我国科学家首次绘制脊索动物完整单细胞转录谱系

  解析细胞命运决定过程的转录动态是发育生物学的核心问题之一,对了解发育基本规律以及干细胞分化的转化起到关键性的作用。近年来,随着单细胞基因组学的兴起,解决了细胞种类的多样性和发育过程的不确定性带来的难题,使得理解胚胎发育细胞谱系变成可能,为研究细胞命运决定提供了技术基础。近期,昆明理工大学陈凯教授牵头的国际合作团队在国际最著名期刊Nature杂志上,发表了题为“Compreh

2019-09-19

研究人员揭示超级增强子动态甲基化调控转录异质性

 CpG DNA甲基化早在70年代就被提出是一种用来控制基因表达的DNA化学修饰,而我们对DNA甲基化在基因组不同区域的具体功能,在疾病、发育过程中所扮演的具体角色,以及控制基因表达的详细机理,直到今天并没有全面详细的认知。2019年8月15日,美国Whitehead研究所Rudolf Jaenisch联合其他课题组在Molecular Cell上发表文章Dynamic Enhancer

2019-09-14

研究发现CREB/ATF碱性亮氨酸拉链转录因子调控肝脏组织再生的新机制

8月30日,国际学术期刊Hepatology 在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所李于研究组的最新研究成果“CREBZF as a key regulator of STAT3 pathway in the control of liver regeneration in mice”,该研究发现在肝脏受到损伤或者部分切除的情况下,CREB/ATF碱性亮氨酸拉链转录因子(CREBZF)可以通过调

2019-09-07