Cell Genomics：刘琦/严钢团队开发TCR和T细胞转录组跨模态整合分析的AI框架——UniTCR
UniTCR提出了一种低质跨模态场景下的免疫组学有效整合和表征的AI框架，以赋能诸多免疫数字解码相关的下游任务分析。
2024-05-06
Science：科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型
研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序，当分析了数以万计已知的人类启动子数据后，这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成，即基序、启动子和三核苷酸（trinucleotides）。
2024-05-27
大学池塘中的神奇生物，基因转录规则“与众不同”
DNA就像建筑物的蓝图，它本身不做任何事情但下达必要的指令。为了让基因产生影响，必须先读取DNA，再将其构建成具有物理效应的分子。
2024-07-15
Science：剪接体对RNA转录本的编辑延迟会导致细胞死亡
在这项新的研究中，这些作者如今发现了一种以更微妙的方式干扰剪接过程的机制。它与剪接体的一个由三种亚基U4、U5 和 U6组成的特定部分有关。
2024-11-28
转录因子早期生长反应3 (Egr3)是心脏瓣膜形态发生所需的机械敏感转录因子基因
本研究揭示了一个以前未知的信号轴，其中EGR3是转导心脏瓣膜形成所需的机械信号所必需的，也可能是左室AD瓣膜重塑所需的机械信号。
2024-05-27
Nature：转录与翻译的协奏曲！揭示基因表达耦合的新调控模式
研究人员首次在实验室中重建了完整的转录-翻译偶联系统，并利用多色单分子荧光显微镜技术，实时追踪了转录延伸、翻译延伸以及两者之间的耦合。
2024-12-13
Clin Mol Hepatol：肝硬化相关并发症的肠道微生物组和代谢组特征
本研究扩大了针对特定肝硬化相关并发症的肝硬化生物标志物的范围，还强调了肝硬化患者粪便微生物和代谢指标下降的相关性，这些指标与MELD和CTP评分以及AST、ALT、胆红素等临床指标密切相关。
2024-09-29
单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测，并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析，具有广泛的应用场景。
2024-02-21
李程/孙育杰/黄粤团队揭示异倍体对染色质空间结构和转录组的影响
本研究结合Hi-C、RNA-seq、染色体成像和新生RNA成像技术，探究了异倍体ESC相比正常二倍体ESC在染色质三维结构和基因转录层面的变化。
2024-04-12
Cell Metab：吕德官等揭示胶质母细胞瘤中调控表观转录的关键代谢途径
该发现揭示了MDH2是维持GSCs代谢和表观转录组网络的关键环节，为开发更为有效的靶向治疗方案铺平了道路。
2024-11-06