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转录组测序数据分析及案例实践班(第四期)

转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA(Non-coding RNA)。现在主流的非编码RNA又包括:circRMA,microRNAs,及lncRNAs。转录组学是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和 空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。转录组测序(RNA-

2018-03-12

Cell:基于高通量单细胞转录组测序小鼠全细胞图谱发表

 在国家自然科学基金项目(项目编号:31722027)等资助下,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板测序技术绘制小鼠细胞图谱)为题,于2018年2月23日在生命科学国际顶尖期刊Cell(《细胞》)

2018-03-09

体外转录的CRISPR RNA会触发免疫反应

2018年3月9日/生物谷BIOON/---对许多种有机体而言,CRISPR介导的基因组编辑已成为一种构建疾病模型的强大工具,而且它的临床应用正在开发当中。预先组装的CRISPR-Cas9核糖核蛋白(ribonucleoprotein, RNP)复合物由重组Cas9蛋白和体外转录的向导RNA(gRNA)组成,能够被运送到细胞中,同时不存在将外源DNA整合到宿主基因组中的风险,并且具有较少的脱靶效应

2018-03-09

研究揭示转录因子Th-POK在代谢调控中的新功能

 近日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所葛高翔与刘小龙研究组的最新合作研究成果,以Th-POK regulates mammary gland lactation through mTOR-SREBP pathway为题,在线发表在PLOS Genetics上,研究揭示了转录因子Th-POK在代谢调控中的新功能。Th-POK转录因子在T淋巴细胞谱系定向分化过程中发挥

2018-03-07

总局发布眼科光学相干断层扫描仪注册技术审查指导原则的通告

 为加强医疗器械产品注册工作的监督和指导,进一步提高注册审查质量,国家食品药品监督管理总局组织制定了《眼科光学相干断层扫描仪注册技术审查指导原则》,现予发布。特此通告。附件:眼科光学相干断层扫描仪注册技术审查指导原则附件眼科光学相干断层扫描仪注册技术审查指导原则本指导原则旨在指导注册申请人对眼科光学相干断层扫描仪(Optical Coherence Tomography,简称OCT)注册

2018-03-02

Leukemia:新型策略能靶向作用特殊转录因子来抵御白血病发生

2018年3月1日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Leukemia上的研究报告中,来自维也纳兽医大学(University of Veterinary Medicine)的研究人员通过研究开发了一种新策略,其能够靶向作用STAT5转录因子从而更好地抵御白血病的发生。图片来源:www.manchester.ac.uk造血系统癌症,意味着患者机体在血细胞生产的过程中发生明显的改

2018-03-01

从结构上揭示RNA聚合酶III转录起始机制

2018年1月18日/生物谷BIOON/---根据需要读取和解析DNA密码的机制是所有的动物和植物所共有的,而且常常被癌症所劫持。在一项新的研究中,来自英国癌症研究院的研究人员通过使用低温电镜技术(Cryo-EM),以前所未有的细节放大和捕捉这种读取机制的图片。这项关于这种分子机制如何运行的发现可能为开发癌症治疗的新方法开辟新的途径。相关研究结果于2018年1月17日在线发表在Nature期刊上,

2018-01-18

研究揭示Hh信号通路转录因子Ci/Gli蛋白稳定性调控新机制

 中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所赵允研究组的研究成果,以UbcD1 regulates Hedgehog signaling by directly modulating Ci ubiquitination and processing为题,在线发表在EMBO Reports上。该研究发现UbcD1调控了Hh信号通路中关键转录因子Ci/Gli的蛋白稳定性。Hh信号

2018-01-04

新研究颠覆对转录因子的传统认知

2017年12月10日/生物谷BIOON/---转录---将一段DNA转录为用于蛋白合成的RNA模板---是几乎所有细胞过程(包括生长、对刺激物作出反应和繁殖)的基础。如今,在一项新的研究中,来自美国怀特海德生物医学研究所的研究人员推翻了我们对转录是如何受到控制的和转录因子在这个过程中发挥的作用的理解。这种模式转变取决于一种在基因组结构中发挥着关键作用的小分子蛋白,从而让人们对基因转录和表达的控制

2017-12-10

科学家揭示整合单细胞和群体细胞转录组数据推断细胞分化时间的作用

 近日,中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)马普计算生物学伙伴研究所韩敬东研究组,中科院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾研究组,与清华大学沈沁研究组合作发表的论文,以Inference of differentiation time for single cell transcriptomes using cell population reference data为题,在线发表

2017-12-07