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科研人员开发基于深度学习模型的空间转录组精细分辨率细胞注释算法

STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具,在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。

2024-11-10

Nature Methods | 全面评估长读长RNA测序:揭示转录组分析新前沿

LRGASP项目通过系统评估多种长读长RNA测序技术和分析工具,提供了对当前最佳实践的深入理解和未来改进的方向。

2024-06-12

Nat Commun:通过整合细胞形态学和空间转录组学深度剖析肿瘤生态系统

METI是一种机器学习方法,它通过整合空间基因表达数据和病理学组织学特征,系统性地分析肿瘤生态系统。

2024-09-04

Cell:揭示Mrc1蛋白能够在DNA复制的滞后链和前导链之间移动组蛋白

最新的研究发现,复制叉保护复合物(FPC)不仅参与DNA复制,还能促进带有特定表观遗传标记的亲代组蛋白被再利用到新的DNA链上,这对于维持表观遗传记忆非常重要。

2024-08-28

Mol Cell | 贾松涛/单淳敏合作揭示复制体蛋白Mrc1在表观遗传信息传递中的关键作用

本研究发现,一个名为Mrc1的复制体蛋白在亲代组蛋白H3-H4向后随链的转移过程中发挥关键作用,从而确保异染色质的正确遗传。

2024-08-05

大脑中的“园丁”与“杂草”Nature:利用空间转录组时钟揭示大脑衰老过程中的细胞邻近效应

这项研究表明,细胞之间的互动——而不仅仅是单个细胞的特性,在塑造衰老过程中起着关键作用。

2024-12-27

研究发现逆转录酶通过重编辑温和噬菌体的基因组赋予其超感染能力

研究证实,添加逆转录酶抑制剂能够抑制生物膜中超感染噬菌体的产生。

2024-11-03

Nature Methods | 解码基因调控新机制:系统性发现人类转录组中的RNA结构开关

该研究展示了RNA结构开关在基因表达调控中的重要性,并强调了开发新的RNA开关鉴定方法的必要性。未来,SwitchSeeker有望被应用于更广泛的转录组研究中,揭示更多关于RNA结构和功能的奥秘。

2024-07-20

Dev Cell:余逸群/余洪猛/刘环海/任雯雯绘制嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱

该研究建立了哺乳动物嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱(图1),解析嗅上皮细胞类型特异性的衰老相关差异表达基因,发现衰老导致嗅上皮中存在激活型HBC,揭示Egr1和Cebpb是转录调控网络中的核心因子。

2024-08-27

Nature子刊:张华凤/高平/孙林冲揭示线粒体定位的MBD2c蛋白促进mtDNA转录和化疗耐药

该研究首次发现甲基结合蛋白MBD2c可以定位至线粒体基质并与线粒体基因组中的NCR结合,并与SIRT3/TFAM形成三元复合物促进mtDNA转录和线粒体呼吸代谢,从而增强乳腺癌细胞对顺铂的化疗耐药。

2024-12-06