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Nature Communications:研究发表单细胞转录组数据检索新方法和参考数据库

 作为细胞异质性研究的重要工具,单细胞转录组测序技术近年来蓬勃发展,并积累了大量研究数据。若能有效利用现有的单细胞数据进行检索与推断,研究者便能更好地进行新测序单细胞的注释,以及综合多数据集的研究。然而,精确的单细胞转录组数据检索和注释需要克服两个挑战:一、数据集之间的批次效应(batch effect)会显着影响细胞检索的可靠性;二、目前缺少跨物

2020-07-15

研究获得青鳉胚胎发育过程中的转录及调控动态图谱

 青鳉(Oryzias latipes)是一种重要的脊椎动物模型,已经在遗传学、发育生物学以及环境科学等领域广泛应用。目前,青鳉已有高质量的基因组序列,以及大量可用的遗传学技术手段。然而,目前的青鳉基因组注释主要是基于生物信息学预测和短读长的转录组测序数据,仍然存在很多问题。低质量的基因组注释是利用青鳉作为模式动物进行组学和系统生物学研究的重要障碍

2020-07-07

“脑回路”大揭秘!华东师大发布多项脑研究新成果

 华东师范大学心理与认知科学院的胡谊教授及其团队,采用基于功能性近红外光成像(functional near infrared spectroscopy, fNIRS)的大脑超扫描技术,对教学材料所引发的学生偏好,教师呈现材料的方法,以及师生之间的大脑同步,进行深入研究。华东师大发布多项脑研究新成果目前,在线教育是大中小学校的主要教学活动形式。学生

2020-06-11

Cell Rep:3D打印大脑结构揭示神经回路结构

在最近一项研究中,作者通过开发自动化的3D脑成像数据分析技术提供了对复杂神经回路的空间组织的更可靠和标准化的分析。

2020-06-09

R环结构或能与转录因子Sox2协调作用来调节细胞重编程的多能性

2020年6月14日 讯 /生物谷BIOON/ --R环(R-loops)细胞中的特殊结构,其由RNA-DNA杂交体和可被取代的单链DNA组成,通常在转录基因附近被发现,然而,R环通常也是一种动态和广泛的实体结构,其在基因组中扮演着并不明确的调节和表观遗传角色。图片来源:CC0 Public Domain近日,一项刊登在国际杂志Science Advance

2020-06-14

研究揭示拟南芥DOF转录因子CDF4加快叶片衰老和花器脱落的新机制

 6月2日,国际学术期刊EMBO Reports 在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心蔡伟明研究组题为Transcription factor CDF4 promotes leaf senescence and floral organ abscission by regulating abscisic acid and reactive

2020-06-05

Frontiers in Pharmacology:新型小分子能够影响转录调控过程

近日,根据Insilico Medicine在《Frontiers in Pharmacology》杂志上发表的名为“Molecular Generation for Desired Transcriptome Changes With Adversarial Autoencoders”的新研究论文,首次针对特定的转录反应创建了靶向性的分子结构用于调节其活性。

2020-05-21

研究人员利用RNA编辑策略实现对逆转录转座子的编辑干预

 5月19日,Cell Discovery 在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所研究员郝沛利用RNA编辑策略、编辑干预逆转录转座子的合作研究论文:Interfering with retrotransposition by two types of CRISPR effectors: Cas12a and Cas13a。该研究利用逆转录病毒/逆转录

2020-05-22

“拟南芥转录因子基因BP在调控植物种子萌发中的应用”获发明专利

 拟南芥又名鼠耳芥、阿拉伯芥、阿拉伯草,拉丁文名为Arabidopsis thaliala (L.) Heynh。拟南芥作为一种草本植物广泛分布于欧亚大陆和非洲西北部。在我国的内蒙、新疆、陕西、甘肃、西藏、山东、江苏、安徽、湖北、四川、云南等省区均有生长。拟南芥植株较小(一个8cm见方的培养钵可种植4-10株)、生长周期短(从发芽到开花约4-6周)

2020-05-16

Nature:科学家发现肠-脑回路糖分感受器 或能解释为何我们对糖类无比热爱?

2020年5月9日 讯 /生物谷BIOON/ --人工甜味剂似乎从来没有完全成功模拟过糖,近日,一项刊登在国际杂志Nature上的研究报告中,来自哥伦比亚大学等机构的科学家们通过对小鼠研究识别出了一种可能解释这种现象的大脑机制。图片来源:Hwei-Ee Tan/Zuker lab/Columbia's Zuckerman Institute研究者发现,大脑不

2020-05-09